RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 A0A1B0GW55 424 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 POM121BA6NF01 834 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 PHOX2AO14813 284 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 IKBKBO14920 756 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 SNPHO15079 494 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 SGSM2O43147 1006 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 SPINT1O43278 529 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 LIASO43766 372 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 NUAK1O60285 661 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 GPR37L1O60883 481 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF432O94892 652 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 KCNK5O95279 499 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 TSPAN13O95857 204 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 C1RP00736 705 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 HPXP02790 462 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 DUX4L2P0CJ85 424 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 DUX4L3P0CJ86 424 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 DUX4L4P0CJ87 422 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 DUX4L5P0CJ88 424 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 DUX4L6P0CJ89 424 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 DUX4L7P0CJ90 424 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 TFPIP10646 304 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 PVRP15151 417 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 CRISP2P16562 243 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 KRT15P19012 456 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 PTPN4P29074 926 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 ADD1P35611 737 aaKnown RBP-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 GMPRP36959 345 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 PHKA2P46019 1235 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 PHKA1P46020 1223 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 LHX1P48742 406 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 EVX1P49640 407 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 ARSDP51689 593 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF136P52737 540 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 NAGLUP54802 743 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 PRR5P85299 388 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 REG3AQ06141 175 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 DAG1Q14118 895 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 EFNB3Q15768 340 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 NFE2L2Q16236 605 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 MAN2A1Q16706 1144 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 PARP10Q53GL7 1025 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 CCDC181Q5TID7 509 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 GPAT2Q6NUI2 795 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF613Q6PF04 617 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 KIAA0408Q6ZU52 694 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 FBXO11Q86XK2 927 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 CADM3Q8N126 398 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 LINC00528Q8N1L1 170 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 ESX1Q8N693 406 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 ZBTB44Q8NCP5 570 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 TBC1D16Q8TBP0 767 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 PCED1BQ96HM7 432 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 LRCH3Q96II8 777 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 HSH2DQ96JZ2 352 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 SUSD3Q96L08 255 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 DCBLD2Q96PD2 775 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 ZSWIM1Q9BR11 485 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 BCL2L12Q9HB09 334 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 CHST7Q9NS84 486 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF224Q9NZL3 707 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 DUX4Q9UBX2 424 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 TULP4Q9NRJ4 1543 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 UBR3Q6ZT12 1888 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 DOCK6Q96HP0 2047 aa-1.67□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 NUP98P52948 1817 aa-1.68□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-1.68□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 TANC1Q9C0D5 1861 aa-1.68□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 A0A096LNT2 108 aa-1.68□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 A0A0A0MRY4 1105 aa-1.68□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa-1.68□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa-1.68□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 A0A1W2PRU2 124 aa-1.68□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 FAM168BA1KXE4 195 aa-1.68□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 C19orf71A6NCJ1 209 aa-1.68□□□□□ -2.68
SNORD54-201ENST00000459159 GOLGA8AA7E2F4 631 aa-1.68□□□□□ -2.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms