RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431381.5

CITED1-206, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CITED1, Length 941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-206ENST00000431381 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.2□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 HIPK3Q9H422 1215 aa14.2□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 SNTG2Q9NY99 539 aa14.2□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 FAM189A1O60320 539 aa14.19□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 COL6A1P12109 1028 aa14.19□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 PIK3CAP42336 1068 aa14.19□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 RBL2Q08999 1139 aa14.19□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 KCNMA1Q12791 1236 aa14.19□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 DUOXA2Q1HG44 320 aa14.19□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 WDR49Q8IV35 697 aa14.19□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 CNGA4Q8IV77 575 aa14.19□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 TMEM192Q8IY95 271 aa14.19□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 TOX2Q96NM4 488 aa14.19□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 TMEM117Q9H0C3 514 aa14.19□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.19□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 SIK3Q9Y2K2 1263 aa14.19□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 CITO14578 2027 aa14.19□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 LACTBL1A8MY62 500 aa14.18□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 PITPNM1O00562 1244 aa14.18□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 CLTBP09497 229 aa14.18□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 SKIP12755 728 aa14.18□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 ITGA4P13612 1032 aa14.18□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 SLC9A1P19634 815 aa14.18□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 PON1P27169 355 aa14.18□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 CASP14P31944 242 aa14.18□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 ADKP55263 362 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 TRPC3Q13507 836 aa14.18□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 WDR44Q5JSH3 913 aa14.18□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 C1orf220Q5T0J3 134 aa14.18□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 C1orf53Q5VUE5 145 aa14.18□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 SV2AQ7L0J3 742 aa14.18□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 CD302Q8IX05 232 aa14.18□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 FBXL13Q8NEE6 735 aa14.18□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 KIF12Q96FN5 646 aa14.18□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 IMPG2Q9BZV3 1241 aa14.18□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 ASB7Q9H672 318 aa14.18□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 FAM105AQ9NUU6 356 aa14.18□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 HES2Q9Y543 173 aa14.18□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 IPPQ9Y573 584 aa14.18□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa14.18□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 RECQL4O94761 1208 aa14.17□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 PARNO95453 639 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 GYPCP04921 128 aa14.17□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 ACTN1P12814 892 aa14.17□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 AKAP5P24588 427 aa14.17□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 KRT9P35527 623 aa14.17□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 RAB27AP51159 221 aa14.17□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 CCL23P55773 120 aa14.17□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 WNT7BP56706 349 aa14.17□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 FAAP100Q0VG06 881 aa14.17□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 LRMPQ12912 555 aa14.17□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 TMEM132DQ14C87 1099 aa14.17□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 SLC10A6Q3KNW5 377 aa14.17□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 UBXN11Q5T124 520 aa14.17□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 JADE1Q6IE81 842 aa14.17□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 RNF169Q8NCN4 708 aa14.17□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.17□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 SEPT8Q92599 483 aa14.17□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 SPAG5Q96R06 1193 aa14.17□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 ADAM2Q99965 735 aa14.17□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 MTMR12Q9C0I1 747 aa14.17□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa14.17□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.17□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 PLCB1Q9NQ66 1216 aa14.17□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP14.17□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 ANK1P16157 1881 aa14.16□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 A0A1W2PQJ5 194 aa14.16□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 TTC26A0AVF1 554 aa14.16□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 PMM2O15305 246 aa14.16□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 XPOTO43592 962 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 MFAP3LO75121 409 aa14.16□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 HLA-DRAP01903 254 aa14.16□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 NFICP08651 508 aa14.16□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 KRT19P08727 400 aa14.16□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 CLDN10P78369 228 aa14.16□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 GOLGA8FQ08AF8 430 aa14.16□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa14.16□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 RAPGEF1Q13905 1077 aa14.16□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 LRRC26Q2I0M4 334 aa14.16□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 EPC2Q52LR7 807 aa14.16□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 FIGNQ5HY92 759 aa14.16□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 TRIM65Q6PJ69 517 aa14.16□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 TRAF7Q6Q0C0 670 aa14.16□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 OR5B17Q8NGF7 314 aa14.16□□□□□ -0.14
CITED1-206ENST00000431381 TAS1R2Q8TE23 839 aa14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms