RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411352.1

RNU6-195P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 195, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-195P, Length 109 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-195P-201ENST00000411352 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-195P-201ENST00000411352 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RNU6-195P-201ENST00000411352 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-195P-201ENST00000411352 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 GRXCR1A8MXD5 290 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 DTNBO60941 627 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 FAM20BO75063 409 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 ABHD16AO95870 558 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 HMGA2P52926 109 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 ADKP55263 362 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 DPTQ07507 201 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 FHL2Q14192 279 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 MFSD14BQ5SR56 506 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 AFMIDQ63HM1 303 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 KCNV1Q6PIU1 500 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 SEM1Q6ZVN7 128 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 RSPH3Q86UC2 560 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 ULK2Q8IYT8 1036 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 Q8N1X5 172 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 AOPEPQ8N6M6 819 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 CLIP3Q96DZ5 547 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 CEP95Q96GE4 821 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 CEP89Q96ST8 783 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 MRI1Q9BV20 369 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 PCED1AQ9H1Q7 454 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 RNPEPQ9H4A4 650 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 MMRN2Q9H8L6 949 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 TDP1Q9NUW8 608 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 INTUQ9ULD6 942 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 GABRDO14764 452 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 MT-CO1P00395 513 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 IARSP41252 1262 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 AVPR1BP47901 424 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 DGCR2P98153 550 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 SLC25A3Q00325 362 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 CDC42EP1Q00587 391 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 RAB39AQ14964 217 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 FOXR2Q6PJQ5 311 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 RHOT2Q8IXI1 618 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 RHOT1Q8IXI2 618 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 FAM43AQ8N2R8 423 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 MIER2Q8N344 545 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 TRIM8Q9BZR9 551 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 DMRT3Q9NQL9 472 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 ATRNL1Q5VV63 1379 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 DRGXA6NNA5 263 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 KATNA1O75449 491 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 RPS6KA4O75676 772 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 ARIH2O95376 493 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 DDCP20711 480 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 CTXN1P60606 82 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 MTM1Q13496 603 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 UBXN2BQ14CS0 331 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 PTPN21Q16825 1174 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 ABCB5Q2M3G0 1257 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 DACT2Q5SW24 774 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 AGAP9Q5VTM2 703 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 MRGPRGQ86SM5 289 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 TTC7BQ86TV6 843 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 PPM1NQ8N819 430 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 REPS2Q8NFH8 660 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 PROKR1Q8TCW9 393 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 CCHCR1Q8TD31 782 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 NRG4Q8WWG1 115 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 JADE3Q92613 823 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 MED15Q96RN5 788 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 MRIQ9BWK5 157 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 AKIP1Q9NQ31 210 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 RNF181Q9P0P0 153 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 CHST2Q9Y4C5 530 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 NOX1Q9Y5S8 564 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 TMEM200CA6NKL6 621 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 B3GALT2O43825 422 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 ALDH1A3P47895 512 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-195P-201ENST00000411352 USP14P54578 494 aa4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms