RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 SELPP16109 830 aa25.22■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 GRM5P41594 1212 aa25.22■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 GBP6Q6ZN66 633 aa25.22■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 LMO3Q8TAP4 145 aa25.22■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa25.22■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 MXI1P50539 228 aa25.22■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 ENPEPQ07075 957 aa25.22■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 EFCAB13Q8IY85 973 aa25.22■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 ELMO3Q96BJ8 720 aa25.22■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 TOX2Q96NM4 488 aa25.22■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 ACAP3Q96P50 834 aa25.22■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 CGRRF1Q99675 332 aa25.22■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 TMEM8AQ9HCN3 771 aa25.22■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 DCDC2CA8MYV0 355 aa25.21■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 EN2P19622 333 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 AKAP5P24588 427 aa25.21■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa25.21■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 USP37Q86T82 979 aa25.21■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 TAS1R2Q8TE23 839 aa25.21■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 SEMA4DQ92854 862 aa25.21■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 APOL6Q9BWW8 343 aa25.21■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 SIX2Q9NPC8 291 aa25.21■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 RNF19AQ9NV58 838 aa25.21■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.632e-9■□□□□ 10.9
CNN3-202ENST00000394202 TLR3O15455 904 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 BFSP2Q13515 415 aa25.2■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 KRT39Q6A163 491 aa25.2■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 PPFIBP1Q86W92 1011 aa25.2■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 TC2NQ8N9U0 490 aa25.2■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 IPPQ9Y573 584 aa25.2■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 SQORQ9Y6N5 450 aa25.2■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa25.2■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 NBNO60934 754 aa25.2■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 GTF2H1P32780 548 aa25.2■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 DSC3Q14574 896 aa25.2■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 EPC2Q52LR7 807 aa25.2■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 CCDC51Q96ER9 411 aa25.2■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 CHST12Q9NRB3 414 aa25.2■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 PCDH10Q9P2E7 1040 aa25.2■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 PITPNM1O00562 1244 aa25.19■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 LRMPQ12912 555 aa25.19■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 GJB7Q6PEY0 223 aa25.19■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 TRIM65Q6PJ69 517 aa25.19■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 USP38Q8NB14 1042 aa25.19■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa25.19■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 MTMR12Q9C0I1 747 aa25.19■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 HIPK3Q9H422 1215 aa25.19■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa25.19■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 MEIS3P2A8K0S8 358 aa25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 PMM2O15305 246 aa25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 STX10O60499 249 aa25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 RECQL4O94761 1208 aa25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 NFICP08651 508 aa25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 KYAT1Q16773 422 aa25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 ZACNQ401N2 412 aa25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 JADE1Q6IE81 842 aa25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 NECAB2Q7Z6G3 386 aa25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 WDR49Q8IV35 697 aa25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 EHBP1Q8NDI1 1231 aa25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 SCLYQ96I15 445 aa25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 GANQ9H2C0 597 aa25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 KCNF1Q9H3M0 494 aa25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 COQ4Q9Y3A0 265 aa25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 ANK1P16157 1881 aa25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 P4HA2O15460 535 aa25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 VNN1O95497 513 aa25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 CCL23P55773 120 aa25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 NEK11Q8NG66 645 aa25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 ADAM2Q99965 735 aa25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 WNT8AQ9H1J5 351 aa25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 FAM105AQ9NUU6 356 aa25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 KLK14Q9P0G3 267 aa25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 CAPN11Q9UMQ6 739 aa25.18■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 IL18RAPO95256 599 aa25.17■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 CYP2C18P33260 490 aa25.17■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa25.17■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 PLCB1Q9NQ66 1216 aa25.17■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 TBX21Q9UL17 535 aa25.17■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CNN3-202ENST00000394202 MFAP3LO75121 409 aa25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms