RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 NRBP2Q9NSY0 501 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 IL37Q9NZH6 218 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 DOLKQ9UPQ8 538 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC61Q9Y6R9 512 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 KIF24Q5T7B8 1368 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 RIMBP2O15034 1052 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PGRP06401 933 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CPB1P15086 417 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CPA3P15088 417 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CASP2P42575 452 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PRAMEP78395 509 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 RELAQ04206 551 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ENPEPQ07075 957 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 KCTD21Q4G0X4 260 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 AGMOQ6ZNB7 445 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CCNJLQ8IV13 435 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 AGR3Q8TD06 166 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 SPZ1Q9BXG8 430 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 VPS11Q9H270 941 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF19AQ9NV58 838 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 SPEF1Q9Y4P9 236 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 SNX9Q9Y5X1 595 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 BECN2A8MW95 431 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 RRP8O43159 456 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ZBTB14O43829 449 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 DNAJB5O75953 348 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ZBED1O96006 694 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CTHP32929 405 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 RENBPP51606 427 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CACNB3P54284 484 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 LSAMPQ13449 338 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 C4orf22Q6V702 233 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 HDXQ7Z353 690 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PJA1Q8NG27 643 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC77Q9BR77 488 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 HERPUD2Q9BSE4 406 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 VCX3AQ9NNX9 186 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 MCM9Q9NXL9 1143 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM10Q9UDY6 481 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ENOPH1Q9UHY7 261 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 AGAP1Q9UPQ3 857 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 SH3TC1Q8TE82 1336 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 SMPD2O60906 423 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PDE6AP16499 860 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CCNA2P20248 432 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 SERPINB4P48594 390 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGDIAP52565 204 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 APBA1Q02410 837 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 KIF5AQ12840 1032 aa7.26□□□□□ -1.25
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RABGEF1-202ENST00000380828 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa7.26□□□□□ -1.25
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RABGEF1-202ENST00000380828 SLC13A1Q9BZW2 595 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CBX8Q9HC52 389 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM8A1Q9UBU6 413 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 L1RE1Q9UN81 338 aa7.26□□□□□ -1.25
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RABGEF1-202ENST00000380828 PCM1Q15154 2024 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 MYO3BQ8WXR4 1341 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 HIP1O00291 1037 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 MAPK13O15264 365 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 HSMCR30P0CW71 290 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PFKPQ01813 784 aa7.26□□□□□ -1.25
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