RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25-201ENST00000348333 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF25-201ENST00000348333 NT5C3AQ9H0P0 336 aa24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF25-201ENST00000348333 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF25-201ENST00000348333 ASGR2P07307 311 aa24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 HARSP12081 509 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 PLS3P13797 630 aa24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 GRM5P41594 1212 aa24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM171A1Q5VUB5 890 aa24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 CD300LGQ6UXG3 332 aa24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 FOXD4L1Q9NU39 408 aa24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 CLIC4Q9Y696 253 aa24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 MUC6Q6W4X9 2439 aa24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 TGM5O43548 720 aa24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 CLCNKBP51801 687 aa24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 KARSQ15046 597 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 SEZ6Q53EL9 994 aa24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 CEP57Q86XR8 500 aa24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 KREMEN2Q8NCW0 462 aa24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 C3orf58Q8NDZ4 430 aa24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 ASIC4Q96FT7 647 aa24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 TIPINQ9BVW5 301 aa24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 C17orf75Q9HAS0 396 aa24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 WDFY4Q6ZS81 3184 aa24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 ADAM12O43184 909 aa24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 MAPTP10636 758 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 PLCG1P19174 1290 aa24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 RESTQ13127 1097 aa24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 LILRA6Q6PI73 481 aa24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 MPZL3Q6UWV2 235 aa24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 ALKAL1Q6UXT8 129 aa24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 USP49Q70CQ1 688 aa24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMEM130Q8N3G9 435 aa24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 SPIRE2Q8WWL2 714 aa24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 AK8Q96MA6 479 aa24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 REEP2Q9BRK0 252 aa24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 FNIP2Q9P278 1114 aa24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 I3L4J1 428 aa24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 BRD1O95696 1058 aa24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 SIGLEC14Q08ET2 396 aa24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 MCM6Q14566 821 aa24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 PTPAQ15257 358 aa24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 XKR4Q5GH76 650 aa24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 GPBP1Q86WP2 473 aa24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM122AQ96E09 287 aa24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 SNX27Q96L92 541 aa24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 CLSTN3Q9BQT9 956 aa24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 TTPALQ9BTX7 342 aa24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 HAPLN2Q9GZV7 340 aa24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 LIMD1Q9UGP4 676 aa24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 ANK1P16157 1881 aa24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 MCF2P10911 925 aa24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 SYT1P21579 422 aa24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 UBA7P41226 1012 aa24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 PSMD5Q16401 504 aa24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 SPECC1Q5M775 1068 aa24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCDC149Q6ZUS6 474 aa24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 PIK3R5Q8WYR1 880 aa24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 PBXIP1Q96AQ6 731 aa24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 TCHPQ9BT92 498 aa24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 B3GAT3O94766 335 aa24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 BRCC3P46736 316 aa24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 NCKAP1LP55160 1127 aa24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 UPP1Q16831 310 aa24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 GPR65Q8IYL9 337 aa24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 KCTD17Q8N5Z5 321 aa24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 CALML4Q96GE6 196 aa24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 KCND2Q9NZV8 630 aa24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 USTQ9Y2C2 406 aa24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 BMP15O95972 392 aa24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 LONP1P36776 959 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 YARSP54577 528 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 STRN3Q13033 797 aa24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF25-201ENST00000348333 RAD54LQ92698 747 aa24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms