RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341472.9

SYNE2-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SYNE2, Length 1,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE2-201ENST00000341472 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 PROZP22891 400 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 CREMQ03060 361 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 GLRA4Q5JXX5 417 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 MPZL3Q6UWV2 235 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 CEP57Q86XR8 500 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 CEP120Q8N960 986 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 TTPALQ9BTX7 342 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 MAN1C1Q9NR34 630 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 C5orf42Q9H799 3197 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 TOM1L1O75674 476 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 B3GAT3O94766 335 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 SPATA31D3P0C874 917 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 MYBP10242 640 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 PLCG1P19174 1290 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 RESTQ13127 1097 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 MCM6Q14566 821 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 PTPAQ15257 358 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 XKR4Q5GH76 650 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 ALKAL1Q6UXT8 129 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 ZPBP2Q6X784 338 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 TRIM67Q6ZTA4 783 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 RAD54LQ92698 747 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 UROC1Q96N76 676 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 ODF2LQ9ULJ1 636 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 USTQ9Y2C2 406 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNE2-201ENST00000341472 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 C2CD4DB7Z1M9 353 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 FAM13AO94988 1023 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 HARSP12081 509 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 RPL17P18621 184 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 DDIT3P35638 169 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 PTPN21Q16825 1174 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 RTP2Q5QGT7 225 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 LILRA6Q6PI73 481 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 CYP26C1Q6V0L0 522 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 MYCT1Q8N699 235 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 REEP2Q9BRK0 252 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 MTMR6Q9Y217 621 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 ABLIM1O14639 778 aa22.06■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 CLDN3O15551 220 aa22.06■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 TGM5O43548 720 aa22.06■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 CLCNKBP51801 687 aa22.06■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 PDXDC1Q6P996 788 aa22.06■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.06■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.06■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa22.06■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 FEZF2Q8TBJ5 459 aa22.06■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 LRRC15Q8TF66 581 aa22.06■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.06■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 EPSTI1Q96J88 318 aa22.06■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.06■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
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SYNE2-201ENST00000341472 M0R296 226 aa22.05■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 TRAPPC3O43617 180 aa22.05■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 KCNE1P15382 129 aa22.05■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 SCP2P22307 547 aa22.05■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 NCKAP1LP55160 1127 aa22.05■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 UPP1Q16831 310 aa22.05■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 SPECC1Q5M775 1068 aa22.05■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 CCDC149Q6ZUS6 474 aa22.05■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.05■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 USP49Q70CQ1 688 aa22.05■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 OTOP3Q7RTS5 596 aa22.05■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 KREMEN2Q8NCW0 462 aa22.05■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 BICD1Q96G01 975 aa22.05■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.05■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 PARVGQ9HBI0 331 aa22.05■■□□□ 1.12
SYNE2-201ENST00000341472 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.05■■□□□ 1.12
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