RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 ARID3AQ99856 593 aa19.28■□□□□ 0.68
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ACTB-201ENST00000331789 FLRT1Q9NZU1 646 aa19.28■□□□□ 0.68
ACTB-201ENST00000331789 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
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ACTB-201ENST00000331789 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP19.27■□□□□ 0.68
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ACTB-201ENST00000331789 IQCF3P0C7M6 154 aa19.27■□□□□ 0.68
ACTB-201ENST00000331789 ABCB4P21439 1286 aa19.27■□□□□ 0.68
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ACTB-201ENST00000331789 ATF7IP2Q5U623 682 aa19.26■□□□□ 0.67
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ACTB-201ENST00000331789 MSANTD4Q8NCY6 345 aa19.25■□□□□ 0.67
ACTB-201ENST00000331789 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
ACTB-201ENST00000331789 ANK1P16157 1881 aa19.25■□□□□ 0.67
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD62A6NC57 917 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-201ENST00000331789 PHACTR2O75167 634 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-201ENST00000331789 PHKA2P46019 1235 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-201ENST00000331789 OSTNP61366 133 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-201ENST00000331789 GRIK4Q16099 956 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-201ENST00000331789 ZNF568Q3ZCX4 644 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-201ENST00000331789 MS4A14Q96JA4 679 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-201ENST00000331789 ISCUQ9H1K1 167 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-201ENST00000331789 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
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