RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 FBXW11Q9UKB1 542 aa27.6■■■□□ 2.01
PPP4R4-202ENST00000328839 MYH15Q9Y2K3 1946 aa27.59■■■□□ 2.01
PPP4R4-202ENST00000328839 KRBA1A5PL33 1030 aa27.59■■■□□ 2.01
PPP4R4-202ENST00000328839 PRR23AA6NEV1 266 aa27.59■■■□□ 2.01
PPP4R4-202ENST00000328839 PAPLNO95428 1278 aa27.59■■■□□ 2.01
PPP4R4-202ENST00000328839 FSHRP23945 695 aa27.59■■■□□ 2.01
PPP4R4-202ENST00000328839 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
PPP4R4-202ENST00000328839 GLRA4Q5JXX5 417 aa27.59■■■□□ 2.01
PPP4R4-202ENST00000328839 PPM1LQ5SGD2 360 aa27.59■■■□□ 2.01
PPP4R4-202ENST00000328839 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM184AQ8NB25 1140 aa27.59■■■□□ 2.01
PPP4R4-202ENST00000328839 DTWD2Q8NBA8 298 aa27.59■■■□□ 2.01
PPP4R4-202ENST00000328839 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
PPP4R4-202ENST00000328839 LRWD1Q9UFC0 647 aa27.59■■■□□ 2.01
PPP4R4-202ENST00000328839 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
PPP4R4-202ENST00000328839 POLIQ9UNA4 740 aa27.59■■■□□ 2.01
PPP4R4-202ENST00000328839 CFAP54Q96N23 3096 aa27.59■■■□□ 2.01
PPP4R4-202ENST00000328839 MUTP22033 750 aa27.58■■■□□ 2.01
PPP4R4-202ENST00000328839 RBM25P49756 843 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
PPP4R4-202ENST00000328839 EFNA5P52803 228 aa27.58■■■□□ 2.01
PPP4R4-202ENST00000328839 NBR1Q14596 966 aa27.58■■■□□ 2.01
PPP4R4-202ENST00000328839 ANGPT1Q15389 498 aa27.58■■■□□ 2.01
PPP4R4-202ENST00000328839 NAB2Q15742 525 aa27.58■■■□□ 2.01
PPP4R4-202ENST00000328839 ECM1Q16610 540 aa27.58■■■□□ 2.01
PPP4R4-202ENST00000328839 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa27.58■■■□□ 2.01
PPP4R4-202ENST00000328839 KIFAP3Q92845 792 aa27.58■■■□□ 2.01
PPP4R4-202ENST00000328839 KIAA1024Q9UPX6 916 aa27.58■■■□□ 2.01
PPP4R4-202ENST00000328839 C8AP07357 584 aa27.57■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 NTHL1P78549 312 aa27.57■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 ATF7IP2Q5U623 682 aa27.57■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 PDXDC1Q6P996 788 aa27.57■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 GPR152Q8TDT2 470 aa27.57■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 NUMBLQ9Y6R0 609 aa27.57■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 CCL16O15467 120 aa27.56■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 ADAM12O43184 909 aa27.56■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP27.56■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 HTR4Q13639 388 aa27.56■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 NT5DC1Q5TFE4 455 aa27.56■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 TBC1D17Q9HA65 648 aa27.56■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 B3GAT3O94766 335 aa27.55■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP27.55■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 TRAPPC10P48553 1259 aa27.55■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 SNX29Q8TEQ0 813 aa27.55■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC169A6NNP5 214 aa27.54■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 ANHXE9PGG2 379 aa27.54■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 K7ERI5 159 aa27.54■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 XYLBO75191 536 aa27.54■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 OR1D2P34982 312 aa27.54■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 CLCNKBP51801 687 aa27.54■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC7A14Q8TBB6 771 aa27.54■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 VPS13AQ96RL7 3174 aa27.54■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 ARHGEF3Q9NR81 526 aa27.54■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 SPECC1Q5M775 1068 aa27.53■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 C4orf32Q8N8J7 132 aa27.53■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 RAB34Q9BZG1 259 aa27.53■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa27.53■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 CDH7Q9ULB5 785 aa27.53■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 CITO14578 2027 aa27.53■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 YARSP54577 528 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 PEX3P56589 373 aa27.52■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 OSTNP61366 133 aa27.52■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 PTGDRQ13258 359 aa27.52■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 TNFSF13BQ9Y275 285 aa27.52■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 STK24Q9Y6E0 443 aa27.52■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 CDY1Q9Y6F8 540 aa27.52■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 MYH11P35749 1972 aa27.51■■■□□ 2
PPP4R4-202ENST00000328839 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
PPP4R4-202ENST00000328839 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa27.51■■□□□ 1.99
PPP4R4-202ENST00000328839 E9PMD0 336 aa27.51■■□□□ 1.99
PPP4R4-202ENST00000328839 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa27.51■■□□□ 1.99
PPP4R4-202ENST00000328839 I3L4J1 428 aa27.51■■□□□ 1.99
PPP4R4-202ENST00000328839 FGFR3P22607 806 aa27.51■■□□□ 1.99
PPP4R4-202ENST00000328839 HOXA9P31269 272 aa27.51■■□□□ 1.99
PPP4R4-202ENST00000328839 RAB33AQ14088 237 aa27.51■■□□□ 1.99
PPP4R4-202ENST00000328839 PDIA5Q14554 519 aa27.51■■□□□ 1.99
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF568Q3ZCX4 644 aa27.51■■□□□ 1.99
PPP4R4-202ENST00000328839 ERICH6BQ5W0A0 696 aa27.51■■□□□ 1.99
PPP4R4-202ENST00000328839 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa27.51■■□□□ 1.99
PPP4R4-202ENST00000328839 PARM1Q6UWI2 310 aa27.51■■□□□ 1.99
PPP4R4-202ENST00000328839 CEP120Q8N960 986 aa27.51■■□□□ 1.99
PPP4R4-202ENST00000328839 FGF14Q92915 247 aa27.51■■□□□ 1.99
PPP4R4-202ENST00000328839 UROC1Q96N76 676 aa27.51■■□□□ 1.99
PPP4R4-202ENST00000328839 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
PPP4R4-202ENST00000328839 MTRRQ9UBK8 725 aa27.51■■□□□ 1.99
PPP4R4-202ENST00000328839 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa27.51■■□□□ 1.99
PPP4R4-202ENST00000328839 DMDP11532 3685 aa27.51■■□□□ 1.99
PPP4R4-202ENST00000328839 MIA3Q5JRA6 1907 aa27.51■■□□□ 1.99
PPP4R4-202ENST00000328839 TRAPPC3O43617 180 aa27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms