RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 TNFAIP2Q03169 654 aa24.53■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 TAF3Q5VWG9 929 aa24.53■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 SPOPLQ6IQ16 392 aa24.53■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 BRSK2Q8IWQ3 736 aa24.53■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 CAGE1Q8TC20 777 aa24.53■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 ARID3AQ99856 593 aa24.53■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 GOLPH3Q9H4A6 298 aa24.53■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 IFT122Q9HBG6 1241 aa24.53■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 C1orf112Q9NSG2 853 aa24.53■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 PCNTO95613 3336 aa24.52■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 MAGEB2O15479 319 aa24.52■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 PROZP22891 400 aa24.52■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 GCNT1Q02742 428 aa24.52■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 ATF7IP2Q5U623 682 aa24.52■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa24.52■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 IFNL1Q8IU54 200 aa24.52■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 PARD6BQ9BYG5 372 aa24.52■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa24.52■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 PTPRHQ9HD43 1115 aa24.52■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 OGTO15294 1046 aa24.52■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 CHRNB2P17787 502 aa24.52■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 TCP1P17987 556 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 DNA2P51530 1060 aa24.52■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 CLCN6P51797 869 aa24.52■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 MEI1Q5TIA1 1274 aa24.52■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 SCARA3Q6AZY7 606 aa24.52■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 MTHFD1LQ6UB35 978 aa24.52■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 C17orf99Q6UX52 265 aa24.52■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHB18PQ96TA0 734 aa24.52■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF236Q9UL36 1845 aa24.52■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 AKT3Q9Y243 479 aa24.52■■□□□ 1.52
VSTM4-201ENST00000298454 COL1A2P08123 1366 aa24.51■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 A0A087WZ62 844 aa24.51■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 VTNP04004 478 aa24.51■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM253P0C7T8 217 aa24.51■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 DGKDQ16760 1214 aa24.51■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 WDR44Q5JSH3 913 aa24.51■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 EEF1DP3Q658K8 133 aa24.51■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 MPZL3Q6UWV2 235 aa24.51■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 TPCN2Q8NHX9 752 aa24.51■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 THAP2Q9H0W7 228 aa24.51■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 CYP11B1P15538 503 aa24.5■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 PPFIA1Q13136 1202 aa24.5■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 CCL14Q16627 93 aa24.5■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM132AQ24JP5 1023 aa24.5■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC57Q8N9N7 239 aa24.5■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 FAM212AQ96EL1 285 aa24.5■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 OSGEPQ9NPF4 335 aa24.5■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 EVPLQ92817 2033 aa24.5■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 MMEP08473 750 aa24.5■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 SLC10A3P09131 477 aa24.5■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 RHOXF2BP0C7M4 288 aa24.5■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 KRT5P13647 590 aa24.5■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 GRIK4Q16099 956 aa24.5■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF568Q3ZCX4 644 aa24.5■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 MARCH8Q5T0T0 291 aa24.5■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa24.5■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 THNSL1Q8IYQ7 743 aa24.5■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGEF26Q96DR7 871 aa24.5■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 RHOXF2Q9BQY4 288 aa24.5■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 NFKBIZQ9BYH8 718 aa24.5■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 TSKSQ9UJT2 592 aa24.5■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 CYP2C19P33261 490 aa24.49■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 CEP120Q8N960 986 aa24.49■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa24.49■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 EHD2Q9NZN4 543 aa24.49■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 CALCAP01258 141 aa24.49■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 CYP2B6P20813 491 aa24.49■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 PHKA2P46019 1235 aa24.49■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 OSTNP61366 133 aa24.49■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 TUBB4BP68371 445 aa24.49■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 FMO1Q01740 532 aa24.49■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 PTPROQ16827 1216 aa24.49■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 SLC35G2Q8TBE7 412 aa24.49■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 NCANO14594 1321 aa24.48■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD62A6NC57 917 aa24.48■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 PHACTR2O75167 634 aa24.48■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 FTLP02792 175 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 TMOD1P28289 359 aa24.48■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 PDE6CP51160 858 aa24.48■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 ISCUQ9H1K1 167 aa24.48■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 PDCL3Q9H2J4 239 aa24.48■■□□□ 1.51
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