RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 TCP10L2B9ZVM9 353 aa26.31■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 BMP3P12645 472 aa26.31■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 UCHL3P15374 230 aa26.31■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 PTGIRP43119 386 aa26.31■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 NPEPPSP55786 919 aa26.31■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 MPP2Q14168 576 aa26.31■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 TMEM179Q6ZVK1 233 aa26.31■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP26.31■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 KLHL23Q8NBE8 558 aa26.31■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 MBOAT7Q96N66 472 aa26.31■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 VPS33BQ9H267 617 aa26.31■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 CLRN2A0PK11 232 aa26.31■■□□□ 1.8
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PKDCC-201ENST00000294964 RPA1P27694 616 aa26.31■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 MARSP56192 900 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 MUM1Q2TAK8 710 aa26.31■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 TRIM74Q86UV6 250 aa26.31■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 TRIM73Q86UV7 250 aa26.31■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 ACER1Q8TDN7 264 aa26.31■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 FGD4Q96M96 766 aa26.31■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 CSRNP1Q96S65 589 aa26.31■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa26.31■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 HAO1Q9UJM8 370 aa26.31■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 PFASO15067 1338 aa26.31■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.31■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 SMAPO00193 183 aa26.3■■□□□ 1.8
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PKDCC-201ENST00000294964 TPH2Q8IWU9 490 aa26.3■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 IDI2Q9BXS1 227 aa26.3■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP26.3■■□□□ 1.84e-9■■■■□ 21.2
PKDCC-201ENST00000294964 GNA14O95837 355 aa26.3■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 AP3B2Q13367 1082 aa26.3■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 STRIP1Q5VSL9 837 aa26.3■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 VSIG1Q86XK7 387 aa26.3■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 PRR12Q9ULL5 1215 aa26.3■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 RARGP13631 454 aa26.29■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 NMT1P30419 496 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 PRKCIP41743 596 aa26.29■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 GALCP54803 685 aa26.29■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 ERP27Q96DN0 273 aa26.29■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 ENTPD5O75356 428 aa26.29■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 USP4Q13107 963 aa26.29■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 ACVR2BQ13705 512 aa26.29■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 MTFR1Q15390 333 aa26.29■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
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PKDCC-201ENST00000294964 ATL2Q8NHH9 583 aa26.29■■□□□ 1.8
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PKDCC-201ENST00000294964 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa26.29■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 CARD9Q9H257 536 aa26.29■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 VAV3Q9UKW4 847 aa26.29■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 SREBF1P36956 1147 aa26.28■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 COG2Q14746 738 aa26.28■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 Q4G0T1 1027 aa26.28■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 AADACL2Q6P093 401 aa26.28■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF333Q96JL9 665 aa26.28■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 NMRK1Q9NWW6 199 aa26.28■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 PON1P27169 355 aa26.28■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 CCDC25Q86WR0 208 aa26.28■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.28■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 WDR18Q9BV38 432 aa26.28■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa26.28■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 SCOCQ9UIL1 159 aa26.28■■□□□ 1.8
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PKDCC-201ENST00000294964 EPHB2P29323 1055 aa26.27■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 SLC35G2Q8TBE7 412 aa26.27■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
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PKDCC-201ENST00000294964 ASTN1O14525 1302 aa26.27■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 NVLO15381 856 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 ATP8B3O60423 1300 aa26.27■■□□□ 1.8
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PKDCC-201ENST00000294964 NIM1KQ8IY84 436 aa26.27■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 MAIP1Q8WWC4 291 aa26.27■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa26.27■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa26.27■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 INTUQ9ULD6 942 aa26.27■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa26.27■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa26.27■■□□□ 1.8
PKDCC-201ENST00000294964 RAD17O75943 681 aa26.26■■□□□ 1.79
PKDCC-201ENST00000294964 ATP5HO75947 161 aa26.26■■□□□ 1.79
PKDCC-201ENST00000294964 NR3C1P04150 777 aa26.26■■□□□ 1.79
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