RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271688.10

CERS2-201, Transcript of ceramide synthase 2, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CERS2, Length 2,544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CERS2-201	ENST00000271688	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	29.49	■■■□□ 2.31	7e-6	■■■■□ 21.9
CERS2-201	ENST00000271688	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		29.49	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	ERLIN2	O94905	339 aa		29.48	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	DSG3	P32926	999 aa		29.48	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	PMS2	P54278	862 aa		29.48	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		29.48	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		29.48	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		29.48	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		29.48	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	29.48	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	29.48	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	DOCK1	Q14185	1865 aa		29.48	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	FDX1	P10109	184 aa		29.48	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	HSPA6	P17066	643 aa		29.48	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	SP2	Q02086	613 aa		29.48	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	29.48	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		29.48	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	29.48	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	29.48	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		29.48	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	PICK1	Q9NRD5	415 aa		29.48	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		29.48	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		29.47	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	MAFG	O15525	162 aa		29.47	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	CAND2	O75155	1236 aa		29.47	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	ACOT2	P49753	483 aa		29.47	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	PPP2R2A	P63151	447 aa		29.47	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	29.47	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		29.47	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		29.47	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	POTEA	Q6S8J7	498 aa		29.47	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		29.47	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		29.47	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	TMEM143	Q96AN5	459 aa		29.47	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	PNMA2	Q9UL42	364 aa		29.47	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	CLDN3	O15551	220 aa		29.47	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	GTF2H1	P32780	548 aa		29.47	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		29.47	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	29.47	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	MORC4	Q8TE76	937 aa		29.47	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	IFT74	Q96LB3	600 aa		29.47	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		29.47	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	29.46	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	LIG3	P49916	1009 aa		29.46	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	USP37	Q86T82	979 aa		29.46	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		29.46	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	TMEM51	Q9NW97	253 aa		29.46	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		29.46	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		29.46	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	ZBTB7A	O95365	584 aa		29.46	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	GART	P22102	1010 aa		29.46	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	LIG4	P49917	911 aa		29.46	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	29.46	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	RWDD2B	P57060	319 aa		29.46	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	29.46	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	PEX10	O60683	326 aa		29.45	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	TNNI1	P19237	187 aa		29.45	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	29.45	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	FSTL1	Q12841	308 aa		29.45	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		29.45	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	29.45	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		29.45	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		29.45	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	29.45	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	PTPRJ	Q12913	1337 aa		29.45	■■■□□ 2.31
CERS2-201	ENST00000271688	SMIM23	A6NLE4	172 aa		29.45	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		29.45	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	29.45	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	29.45	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		29.45	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	GGPS1	O95749	300 aa		29.44	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	GCNT1	Q02742	428 aa		29.44	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	SLC29A2	Q14542	456 aa		29.44	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	DCAF15	Q66K64	600 aa		29.44	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		29.44	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		29.44	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	TLDC2	A0PJX2	215 aa		29.44	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	PODXL	O00592	558 aa		29.44	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	ATP4A	P20648	1035 aa		29.44	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	29.44	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	MAPK4	P31152	587 aa		29.44	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		29.44	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	MDM1	Q8TC05	714 aa		29.44	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	29.43	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	RRM1	P23921	792 aa		29.43	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	SNX1	Q13596	522 aa		29.43	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	EMC2	Q15006	297 aa		29.43	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		29.43	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		29.43	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		29.43	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	29.43	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	29.43	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	CFH	P08603	1231 aa		29.43	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	SCP2	P22307	547 aa		29.43	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	FGFR4	P22455	802 aa		29.43	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	29.43	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	CYP1B1	Q16678	543 aa		29.43	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	29.43	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	DENND2C	Q68D51	928 aa		29.43	■■■□□ 2.3
CERS2-201	ENST00000271688	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		29.43	■■■□□ 2.3

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