RNA–Protein interactions for RNA: YPR175W

DPB2, Transcript of Second largest subunit of DNA polymerase II (DNA polymerase epsilon), yeastyeast

Gene DPB2, Length 2,070 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DPB2YPR175W USE1P53146 245 aa4.76□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W FMP41P53889 259 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W YPL113CQ02961 396 aa4.76□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W MHR1Q06630 226 aa4.76□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W NCB2Q92317 146 aa4.76□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W YPL229WQ99395 206 aa4.76□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa4.76□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W ASP3-2P0CX77 362 aa4.76□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W ASP3-3P0CX78 362 aa4.76□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W ASP3-4P0CX79 362 aa4.76□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W ASP3-1P0CZ17 362 aa4.76□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W YHL049CP38722 271 aa4.76□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W GOS1P38736 223 aa4.76□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W YGL260WP53056 76 aa4.76□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W ASI3P53983 676 aa4.76□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W MRX11Q03079 207 aa4.76□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W HRT3Q12347 344 aa4.76□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W YRF1-1P0CX20 1796 aa4.75□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W YRF1-5P0CX21 1796 aa4.75□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W YRF1-8P0CX22 1796 aa4.75□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W BGL2P15703 313 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W SHC1P39000 512 aa4.75□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W GAB1P41733 394 aa4.75□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W YDR115WQ04598 105 aa4.75□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W TFC7Q12415 435 aa4.75□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W TRM732Q03496 1420 aa4.74□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W STE18P18852 110 aa4.74□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W ISY1P21374 235 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W ADE1P27616 306 aa4.74□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W MMS22Q06164 1454 aa4.74□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W DRS2P39524 1355 aa4.74□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W YBR121C-AP0C5L4 52 aa4.74□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W SMP1P38128 452 aa4.74□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W YRB1P41920 201 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W NIF3P53081 288 aa4.74□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W YPL278CQ08990 100 aa4.74□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W ALK2P32789 676 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W TIP20P33891 701 aa4.73□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data4.73□□□□□ -1.65not detected
DPB2YPR175W MED8P38304 223 aa4.73□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W FMP48P53233 369 aa4.73□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W DNF2Q12675 1612 aa4.73□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W TOP2P06786 1428 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W VPS15P22219 1454 aa4.73□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W MATALPHA2P0CY08 210 aa4.73□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W HMLALPHA2P0CY09 210 aa4.73□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W RPL4AP10664 362 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W SHE3P38272 425 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W RFC4P40339 323 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W YRB2P40517 327 aa4.73□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W CPR7P47103 393 aa4.73□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W RPL4BP49626 362 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W ACT1P60010 375 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W YOL085CQ99345 113 aa4.73□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W NTE1Q04958 1679 aa4.72□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W COS2P0CX12 379 aa4.72□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W COS3P0CX13 379 aa4.72□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W YPT53P36019 220 aa4.72□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W SOL2P37262 315 aa4.72□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W SEN34P39707 275 aa4.72□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W COS4P43542 379 aa4.72□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W ALG13P53178 202 aa4.72□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W PAL1Q05518 499 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W RAX2Q12465 1220 aa4.72□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W RAD9P14737 1309 aa4.72□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W NUP159P40477 1460 aa4.72□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W RFT1P38206 574 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W IGD1P43598 195 aa4.71□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W YJR149WP47177 404 aa4.71□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W IMP4P53941 290 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W RNH201P53942 307 aa4.71□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W API2Q04413 109 aa4.71□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W LIP2Q06005 328 aa4.71□□□□□ -1.65
DPB2YPR175W RFA3P26755 122 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
DPB2YPR175W YGL034CP53186 121 aa4.71□□□□□ -1.66
DPB2YPR175W NOP19P53317 196 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
DPB2YPR175W SRO7Q12038 1033 aa4.71□□□□□ -1.66
DPB2YPR175W SNZ3P43545 298 aa4.7□□□□□ -1.66
DPB2YPR175W YPI1P43587 155 aa4.7□□□□□ -1.66
DPB2YPR175W MGA1P53050 456 aa4.7□□□□□ -1.66
DPB2YPR175W TOS8P53147 276 aa4.7□□□□□ -1.66
DPB2YPR175W RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
DPB2YPR175W INP1Q03694 420 aa4.7□□□□□ -1.66
DPB2YPR175W ECM19Q06011 112 aa4.7□□□□□ -1.66
DPB2YPR175W YPR098CQ06089 161 aa4.7□□□□□ -1.66
DPB2YPR175W RFM1Q12192 310 aa4.7□□□□□ -1.66
DPB2YPR175W CBF1P17106 351 aa4.69□□□□□ -1.66
DPB2YPR175W CDC10P25342 322 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
DPB2YPR175W PRX1P34227 261 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
DPB2YPR175W MRPL3P36516 390 aa4.69□□□□□ -1.66
DPB2YPR175W ARC18Q05933 178 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
DPB2YPR175W VIK1Q12045 647 aa4.69□□□□□ -1.66
DPB2YPR175W TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
DPB2YPR175W RPB9P27999 122 aa4.69□□□□□ -1.66
DPB2YPR175W MRP21P38175 177 aa4.69□□□□□ -1.66
DPB2YPR175W POP8P38208 133 aa4.69□□□□□ -1.66
DPB2YPR175W YFL064CP43540 174 aa4.69□□□□□ -1.66
DPB2YPR175W SNZ2P53824 298 aa4.69□□□□□ -1.66
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