RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	YMC1	P32331	307 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	ECM31	P38122	312 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	COS8	P38723	381 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	PAM16	P42949	149 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	YGL235W	P53071	178 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	CDH1	P53197	566 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	VBA1	Q04301	562 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	NAT4	Q04751	285 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	YMR252C	Q04814	134 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	PEX30	Q06169	523 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	FDH1	Q08911	376 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	RDI1	Q12434	202 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	FSH3	Q99369	266 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	ADH7	P25377	361 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	YEF1	P32622	495 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	MRPL37	P36532	105 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	YIL166C	P40445	542 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	CAT5	P41735	233 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	TOS2	P50078	622 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	SLI1	P53304	468 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	CAF40	P53829	373 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	ASI3	P53983	676 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	GAS2	Q06135	555 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	ATG10	Q07879	167 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	YOR114W	Q12219	294 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	YLR108C	Q12259	485 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	TEL1	P38110	2787 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.07	□□□□□ -1.6	not detected
PSH1	YOL054W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	ERG3	P32353	365 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	EMP70	P32802	667 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	PDC2	P32896	925 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	SFK1	P35735	353 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	YOR062C	P36025	268 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	NSG1	P38837	291 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	UIP3	P39547	235 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	OSW5	P40219	148 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	CTK2	P46962	323 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	YDR541C	Q03049	344 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	YPR127W	Q06494	345 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	NAM9	P27929	486 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	MRP17	P28778	131 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	ECM25	P32525	599 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	TAE1	P38340	232 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	YGL204C	P53089	101 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	FMP48	P53233	369 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	HHO1	P53551	258 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	DCS1	Q06151	350 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	ANT1	Q06497	328 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	YOR385W	Q08909	290 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	YLR111W	Q12528	110 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	YOS9	Q99220	542 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	KIN28	P06242	306 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	HOM3	P10869	527 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	BOS1	P25385	244 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	LDS1	P31379	325 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	SRB6	P32570	121 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	SUA5	P32579	426 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	SEF1	P34228	1148 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	FLO10	P36170	1169 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	MAL32	P38158	584 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	APD1	P38281	316 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	ECM34	P38728	170 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	BMT5	P40493	336 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	TAD2	P47058	250 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	IBA57	P47158	497 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	PHB2	P50085	310 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	VHT1	P53241	593 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSH1	YOL054W	MAL12	P53341	584 aa		5.05	□□□□□ -1.6

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