RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W AVT6P40074 448 aa3.6□□□□□ -1.83
YKR047WYKR047W COX15P40086 486 aa3.6□□□□□ -1.83
YKR047WYKR047W YGR018CP53211 109 aa3.6□□□□□ -1.83
YKR047WYKR047W TSA2Q04120 196 aa3.6□□□□□ -1.83
YKR047WYKR047W SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
YKR047WYKR047W YDL144CQ07589 356 aa3.6□□□□□ -1.83
YKR047WYKR047W TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
YKR047WYKR047W TPI1P00942 248 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
YKR047WYKR047W CDC33P07260 213 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
YKR047WYKR047W STE18P18852 110 aa3.59□□□□□ -1.83
YKR047WYKR047W YMR31P19955 123 aa3.59□□□□□ -1.83
YKR047WYKR047W OSM1P21375 501 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
YKR047WYKR047W YCR102CP25608 368 aa3.59□□□□□ -1.83
YKR047WYKR047W PRP18P33411 251 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
YKR047WYKR047W CBT1P36038 271 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
YKR047WYKR047W CUE1P38428 203 aa3.59□□□□□ -1.83
YKR047WYKR047W RTC3P38804 111 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
YKR047WYKR047W UFE1P41834 346 aa3.59□□□□□ -1.83
YKR047WYKR047W CAX4P53223 239 aa3.59□□□□□ -1.83
YKR047WYKR047W SLX9P53251 210 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
YKR047WYKR047W ACT1P60010 375 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
YKR047WYKR047W MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
YKR047WYKR047W SEY1Q99287 776 aa3.59□□□□□ -1.83
YKR047WYKR047W PHO80P20052 293 aa3.58□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W COX10P21592 462 aa3.58□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W LDB16P25587 256 aa3.58□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W RPB9P27999 122 aa3.58□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W GOS1P38736 223 aa3.58□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W YRB1P41920 201 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W SWT21P53873 357 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W GIM3P53900 129 aa3.58□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W ATG38Q05789 226 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W DXO1Q06349 442 aa3.58□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W COQ10Q08058 207 aa3.58□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W NCB2Q92317 146 aa3.58□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W RPS19AP07280 144 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W RPS19BP07281 144 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W YBR121C-AP0C5L4 52 aa3.57□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W ERG2P32352 222 aa3.57□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W HMT1P38074 348 aa3.57□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W FRT2P39734 528 aa3.57□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W ERG28P40030 148 aa3.57□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W SNZ3P43545 298 aa3.57□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W RPE1P46969 238 aa3.57□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W RAD17P48581 401 aa3.57□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W SNZ2P53824 298 aa3.57□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W NNT1Q05874 261 aa3.57□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W DIB1Q06819 143 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W AUS1Q08409 1394 aa3.57□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W YKL183C-AQ3E765 70 aa3.57□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W YKR104WP0CE69 306 aa3.56□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W CDC10P25342 322 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W URA8P38627 578 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W YHI9P38765 294 aa3.56□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W YHR127WP38833 243 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W BDH1P39714 382 aa3.56□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W SYS1P41544 203 aa3.56□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W COQ5P49017 307 aa3.56□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W YMR166CQ03829 368 aa3.56□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W SPG4Q04438 115 aa3.56□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W JIP3O13555 125 aa3.55□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W YKL075CP36083 450 aa3.55□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W YNL194CP40169 301 aa3.55□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W YFL012WP43580 148 aa3.55□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W RRP40Q08285 240 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W YDL211CQ12121 372 aa3.55□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W GET4Q12125 312 aa3.55□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W YLR126CQ12288 251 aa3.55□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W FUS3P16892 353 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W MGM101P32787 269 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W MRPL39P36533 70 aa3.54□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W YBL081WP38180 368 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W ARN2P38724 620 aa3.54□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W PRE6P40303 254 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W RFC4P40339 323 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W AAH1P53909 347 aa3.54□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W MRX8Q05473 314 aa3.54□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W CDC123Q05791 360 aa3.54□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W YPL150WQ12152 901 aa3.54□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W YRA1Q12159 226 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W SSO1P32867 290 aa3.53□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W YOX1P34161 385 aa3.53□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W MRPS9P38120 278 aa3.53□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W SEO1P39709 593 aa3.53□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W CPR7P47103 393 aa3.53□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W MIC26P50087 233 aa3.53□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W CWC23P52868 283 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W UFD1P53044 361 aa3.53□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W CUS2P53830 285 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W ATG5Q12380 294 aa3.53□□□□□ -1.84
YKR047WYKR047W COS2P0CX12 379 aa3.52□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W COS3P0CX13 379 aa3.52□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W MER1P16523 270 aa3.52□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W CKA2P19454 339 aa3.52□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W GDH2P33327 1092 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W NTF2P33331 125 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W CSG2P35206 410 aa3.52□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W YHL044WP38727 235 aa3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.6 ms