RNA–Protein interactions for RNA: YJL054W

TIM54, Transcript of Component of the mitochondrial TIM22 complex, yeastyeast

Gene TIM54, Length 1,437 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIM54YJL054W PHO90P39535 881 aa4.6□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W RRG9P40156 214 aa4.6□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W QRI7P43122 407 aa4.6□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W SFH5P47008 294 aa4.6□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W PEF1P53238 335 aa4.6□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W YAP1802P53309 568 aa4.6□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W YNL046WP53956 172 aa4.6□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W CIK1Q01649 594 aa4.6□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W NUP49Q02199 472 aa4.6□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W AIM36Q03798 255 aa4.6□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W TAZ1Q06510 381 aa4.6□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W DTD1Q07648 150 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W COX5BP00425 151 aa4.59□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W RPL6BP05739 176 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W RPL15AP05748 204 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W ARO3P14843 370 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W HNM1P19807 563 aa4.59□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W BOS1P25385 244 aa4.59□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W KRR1P25586 316 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W RPS5P26783 225 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W GLC7P32598 312 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W FAT1P38225 669 aa4.59□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W YER121WP40076 114 aa4.59□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W YIL077CP40508 320 aa4.59□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W LOH1P47055 219 aa4.59□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W COS10P52924 374 aa4.59□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W NQM1P53228 333 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W PGA1P53896 198 aa4.59□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W YMR279CQ03263 540 aa4.59□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W RDL1Q12305 139 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W POM34Q12445 299 aa4.59□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W ERP4Q12450 207 aa4.59□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W TMA17Q12513 150 aa4.59□□□□□ -1.67
TIM54YJL054W CCW14O13547 238 aa4.58□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W MSI1P13712 422 aa4.58□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W YAK1P14680 807 aa4.58□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W STE18P18852 110 aa4.58□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W MEK1P24719 497 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W RPB9P27999 122 aa4.58□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W OAC1P32332 324 aa4.58□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W GLR1P41921 483 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W RMD9P53140 646 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W RSM23Q01163 450 aa4.58□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W HOT1Q03213 719 aa4.58□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W DIG2Q03373 323 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W GMC1Q04399 608 aa4.58□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W RRP9Q06506 573 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W RRS1Q08746 203 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W USV1Q12132 391 aa4.58□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W YER145C-AA0A023PYF4 145 aa4.57□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W TPK3P05986 398 aa4.57□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W DSF1P0CX08 502 aa4.57□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W YNR073CP0CX09 502 aa4.57□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W APA2P22108 325 aa4.57□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W PCL1P24867 279 aa4.57□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W FEN2P25621 512 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W RPC34P32910 317 aa4.57□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W SUR1P33300 382 aa4.57□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W YBR138CP38277 524 aa4.57□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W ARO9P38840 513 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W SWP82P43554 623 aa4.57□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W FMP33P46998 180 aa4.57□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W YJR120WP47157 116 aa4.57□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W COG5P53951 403 aa4.57□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W SNA4Q07549 140 aa4.57□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W YML003WP0CF16 290 aa4.56□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W ATR1P13090 542 aa4.56□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W CDC43P18898 376 aa4.56□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W FUN19P28003 413 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W AST1P35183 429 aa4.56□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W MTH1P35198 433 aa4.56□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W FLX1P40464 311 aa4.56□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W SNL1P40548 159 aa4.56□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W GPI17Q04080 534 aa4.56□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W SMP3Q04174 516 aa4.56□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W AIM6Q07716 390 aa4.56□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W LOT6Q07923 191 aa4.56□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W FRE8Q12209 686 aa4.56□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W PCL9Q12477 304 aa4.56□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data4.55□□□□□ -1.68not detected
TIM54YJL054W PDE2P06776 526 aa4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W NAM2P11325 894 aa4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W ECM8P38246 354 aa4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W PUG1P40100 303 aa4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data4.55□□□□□ -1.68not detected
TIM54YJL054W OST1P41543 476 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W BUD8P41698 603 aa4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W YIP4P53093 235 aa4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W YMD8Q03697 442 aa4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W MRX8Q05473 314 aa4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W STP4Q07351 490 aa4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W PST2Q12335 198 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W DBF2P22204 572 aa4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W DEG1P31115 442 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W ECT1P33412 323 aa4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W MCH2P36032 473 aa4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W FRM2P37261 193 aa4.55□□□□□ -1.68
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