RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W-A

RPC10, Transcript of RNA polymerase subunit ABC10-alpha, found in RNA pol I, II, and III, yeastyeast

Gene RPC10, Length 213 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10YHR143W-A DBP3P20447 523 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A RNP1P32385 249 aa1.37□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A GDH2P33327 1092 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A GON7P46984 123 aa1.37□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A YJL028WP47062 111 aa1.37□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A DAN1P47178 298 aa1.37□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A RPL4BP49626 362 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A NBP1P52919 319 aaPredicted RBP1.37□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A LSB1P53281 241 aa1.37□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A CAB4P53332 305 aa1.37□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A COS6P53344 381 aa1.37□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A ATC1Q04005 294 aa1.37□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A STH1P32597 1359 aa1.36□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A POF1P25576 258 aa1.36□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A NRG2P38082 220 aa1.36□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A PRM9P39551 298 aa1.36□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A FMP33P46998 180 aa1.36□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A TAD2P47058 250 aa1.36□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A MNT4P53745 580 aa1.36□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A SWS2P53937 143 aa1.36□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A SPP2Q02521 185 aa1.36□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A PST1Q12355 444 aa1.36□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP1.36□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A RPP0P05317 312 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A EBP2P36049 427 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A YKL070WP36087 169 aa1.35□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A MAL32P38158 584 aa1.35□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data1.35□□□□□ -2.19not detected
RPC10YHR143W-A HSM3P38348 480 aa1.35□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data1.35□□□□□ -2.19not detected
RPC10YHR143W-A NBP35P52920 328 aa1.35□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A MAL12P53341 584 aa1.35□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A AAH1P53909 347 aa1.35□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A ASI3P53983 676 aa1.35□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A PEX12Q04370 399 aa1.35□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A PEX10Q05568 337 aa1.35□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A BOP2Q06150 570 aa1.35□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A GMC2Q06201 188 aa1.35□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A CTR3Q06686 241 aa1.35□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A SME1Q12330 94 aaPredicted RBP1.35□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A GEP5Q12393 293 aa1.35□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A SSA3P09435 649 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A MET16P18408 261 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A CWP1P28319 239 aa1.34□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A YOR062CP36025 268 aa1.34□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A ECM13P38195 257 aa1.34□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A YHL049CP38722 271 aa1.34□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A YJL118WP47022 219 aa1.34□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A BAT2P47176 376 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A MDM34P53083 459 aa1.34□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A EBS1Q03466 884 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A ARV1Q06541 321 aa1.34□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A SLD7Q08457 257 aa1.34□□□□□ -2.19
RPC10YHR143W-A SSK22P25390 1331 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A DDI1P40087 428 aa1.33□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A COA1P40452 197 aa1.33□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A KAP114P53067 1004 aa1.33□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A ERV25P54837 211 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A CDC14Q00684 551 aa1.33□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A EMI1Q04406 187 aa1.33□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A DCR2Q05924 578 aa1.33□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A SAS5Q99314 248 aa1.33□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A ADH3P07246 375 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A SGA1P08019 549 aa1.32□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A SCM4P32564 187 aa1.32□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A RRF1P38771 230 aa1.32□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP1.32□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A YHR086W-AQ3E746 53 aa1.32□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A PUT1P09368 476 aa1.31□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A CCA1P21269 546 aa1.31□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A YCR102CP25608 368 aa1.31□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A RCY1P39531 840 aa1.31□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A DSN1P40568 576 aa1.31□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A OST2P46964 130 aa1.31□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A MAL13P53338 473 aa1.31□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A DAD3P69850 94 aa1.31□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A SNF8Q12483 233 aa1.31□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A HIS1P00498 297 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A PET100P38958 111 aa1.3□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A FCY21P40039 528 aa1.3□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A SNX4P47057 423 aa1.3□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A YJR012CP47087 207 aa1.3□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A EMC2P47133 292 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A RSM10Q03201 203 aa1.3□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A EMP46Q12396 444 aa1.3□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A YBL008W-AQ3E821 79 aa1.3□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A RPL24AP04449 155 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A POX1P13711 748 aa1.29□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A SEC22P22214 214 aa1.29□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A OST6Q03723 332 aa1.29□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A YDR124WQ04608 324 aa1.29□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A ATG17Q06410 417 aa1.29□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A YPL119C-AQ3E751 87 aa1.29□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A VPS3P23643 1011 aa1.28□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A DOA4P32571 926 aa1.28□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A RCN1P36054 211 aa1.28□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A PRS4P38063 326 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A SSH1P38353 490 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A COS8P38723 381 aa1.28□□□□□ -2.2
RPC10YHR143W-A YHB1P39676 399 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
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