RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C

MSC7, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene MSC7, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSC7	YHR039C	STP22	P25604	385 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	GAC1	P28006	793 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	PTM1	P32857	523 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	EMC3	P36039	253 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	QDR3	P38227	689 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	SAP30	P38429	201 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	DOG1	P38774	246 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	PHO90	P39535	881 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	VHS2	P40463	436 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	AZF1	P41696	914 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	YDL186W	P48568	277 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	EXG2	P52911	562 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	MMS2	P53152	137 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	BUD9	P53226	547 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	MRPS35	P53292	345 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.36	□□□□□ -1.71	not detected
MSC7	YHR039C	YDR366C	P87287	132 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	MAK3	Q03503	176 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	TSA2	Q04120	196 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	GRX8	Q05926	109 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	MCH1	Q07376	486 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	FRE8	Q12209	686 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	POM34	Q12445	299 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	CDC20	P26309	610 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	IES6	P32617	166 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	UTR4	P32626	227 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	OMA1	P36163	345 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	RTC2	P38279	296 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	SLM6	P38343	150 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	YJL193W	P39542	402 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	AYR1	P40471	297 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	AIM23	P47015	356 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	CDH1	P53197	566 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	MTL1	P53214	551 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	LST7	P53237	242 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	FRE4	P53746	719 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	YNR071C	P53757	342 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	OSH6	Q02201	448 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	TRI1	Q05024	226 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	RNH202	Q05635	350 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	DIC1	Q06143	298 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	CNL1	Q06333	122 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	LDS2	Q08218	356 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.36	□□□□□ -1.71	not detected
MSC7	YHR039C	NUS1	Q12063	375 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	RAX2	Q12465	1220 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	RHO2	P06781	192 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	ERG11	P10614	530 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	MGT1	P26188	188 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	COQ2	P32378	372 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	DCG1	P32460	244 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	SRB6	P32570	121 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	FMP52	P40008	231 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	DSE1	P40077	573 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	NRG1	Q03125	231 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	HOF1	Q05080	669 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	FDH1	Q08911	376 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	YPL260W	Q08977	551 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	YLR462W	O13556	202 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	CYC7	P00045	113 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	BUB3	P26449	341 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	YKL151C	P36059	337 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	VRP1	P37370	817 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	YBR056W	P38081	501 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	ELO1	P39540	310 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	KRE29	P40026	464 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	EAF6	P47128	113 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	CTR1	P49573	406 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	UBC12	P52491	188 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	YIP1	P53039	248 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	ALG13	P53178	202 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	RAV2	Q03956	351 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	IRC13	Q08630	104 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	COX5B	P00425	151 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	ALG7	P07286	448 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	CDC4	P07834	779 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	ERD1	P16151	362 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	LSB5	P25369	354 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MSC7	YHR039C	VMA3	P25515	160 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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