RNA–Protein interactions for RNA: YGR247W

CPD1, Transcript of Cyclic nucleotide phosphodiesterase, yeastyeast

Gene CPD1, Length 720 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPD1YGR247W NRK1P53915 240 aa7.44□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W YPL067CQ02754 198 aa7.44□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W GAL83Q04739 417 aa7.44□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W DTD1Q07648 150 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W YOR029WQ12243 111 aa7.44□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W PCL9Q12477 304 aa7.44□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W TPK3P05986 398 aa7.43□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W SIR2P06700 562 aa7.43□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W SUA7P29055 345 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W OAC1P32332 324 aa7.43□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W AHP1P38013 176 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W FIG1P38224 298 aa7.43□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W AGE2P40529 298 aa7.43□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W SAY1P53324 424 aa7.43□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W AAH1P53909 347 aa7.43□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W ARR2Q06597 130 aa7.43□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W SOD2P00447 233 aa7.42□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W ILV5P06168 395 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W KIN28P06242 306 aa7.42□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W FBA1P14540 359 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W HXT2P23585 541 aa7.42□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W XPT1P47165 209 aa7.42□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W CCC1P47818 322 aa7.42□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W YKR005CQ02203 525 aa7.42□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W HOT1Q03213 719 aa7.42□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W YMR254CQ04838 102 aa7.42□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W YOR378WQ08902 515 aa7.42□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W RAD52P06778 471 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W SGA1P08019 549 aa7.41□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W SAM35P14693 329 aa7.41□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W RPA135P22138 1203 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W FPS1P23900 669 aa7.41□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W ECT1P33412 323 aa7.41□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W YCR041WP37265 110 aa7.41□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W GDT1P38301 280 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W YER079WP40052 210 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W SWP82P43554 623 aa7.41□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W SCW11P53189 542 aa7.41□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W SLI1P53304 468 aa7.41□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W NOG1Q02892 647 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W SNZ1Q03148 297 aa7.41□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W CAC2Q04199 468 aa7.41□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W PST2Q12335 198 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W RPL24AP04449 155 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W SNF4P12904 322 aa7.4□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W ISC10P32645 267 aa7.4□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W ANR2P36090 516 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W CCZ1P38273 704 aa7.4□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W PMT6P42934 759 aa7.4□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W YGL114WP53134 725 aa7.4□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W YDR514CQ04408 483 aa7.4□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W THP3Q12049 470 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CPD1YGR247W RAS1P01119 309 aa7.39□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W SPS4P09937 338 aa7.39□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W AFG1P32317 509 aa7.39□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W TMA19P35691 167 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W THI2P38141 450 aa7.39□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W SDP1P40479 209 aa7.39□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W PIR5P46999 287 aa7.39□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W PMT5P52867 743 aa7.39□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W YGL159WP53110 370 aa7.39□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W COX18P53239 316 aa7.39□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W COG5P53951 403 aa7.39□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W YMR166CQ03829 368 aa7.39□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W SMP3Q04174 516 aa7.39□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W SPR28Q04921 423 aa7.39□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W PHO4P07270 312 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W ELO2P25358 347 aa7.38□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W MTH1P35198 433 aa7.38□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W NAT2P37293 288 aa7.38□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W ALG14P38242 237 aa7.38□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W DLS1P40366 167 aa7.38□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W PHB2P50085 310 aa7.38□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W BUD17P53727 317 aa7.38□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W YMD8Q03697 442 aa7.38□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W GRC3Q07845 632 aa7.38□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W YGL041W-AP0C5N3 154 aa7.37□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W PDB1P32473 366 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W AVT4P50944 713 aa7.37□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W MRH4P53166 561 aa7.37□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W YGR016WP53209 190 aa7.37□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W YLR152CP54072 576 aa7.37□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W ARP10Q04549 284 aa7.37□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W TMA10Q06177 86 aa7.37□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W GDH1P07262 454 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W PMR1P13586 950 aa7.36□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W ATP10P18496 279 aa7.36□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W PUT3P25502 979 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W VMA3P25515 160 aa7.36□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W PPZ2P33329 710 aa7.36□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W NGL2Q03264 515 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W LIP2Q06005 328 aa7.36□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W VCX1Q99385 411 aa7.36□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W YND1P40009 630 aa7.35□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W YGR045CP53229 120 aa7.35□□□□□ -1.23
CPD1YGR247W VPS71Q03433 280 aa7.35□□□□□ -1.23
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