RNA–Protein interactions for RNA: YBL048W

RRT1, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene RRT1, Length 312 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRT1	YBL048W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	STH1	P32597	1359 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	HSM3	P38348	480 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	SHC1	P39000	512 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	RCY1	P39531	840 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	TAD2	P47058	250 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	TIM21	P53220	239 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	MNT4	P53745	580 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	SWS2	P53937	143 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	GMC2	Q06201	188 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	RAD10	P06838	210 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	COS2	P0CX12	379 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	COS3	P0CX13	379 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	SFC1	P33303	322 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	MRPL37	P36532	105 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	MAL32	P38158	584 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	YHL049C	P38722	271 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	YHR045W	P38775	560 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	GON7	P46984	123 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	YJL028W	P47062	111 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	NBP35	P52920	328 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	KAP114	P53067	1004 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	NIF3	P53081	288 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	MAL12	P53341	584 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	SLM2	P53955	656 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	OST6	Q03723	332 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	ATC1	Q04005	294 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	COX20	Q04935	205 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	PEX10	Q05568	337 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	YOR268C	Q08734	132 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	YPL247C	Q12523	523 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	PPH21	P23594	369 aa		0.86	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	RNP1	P32385	249 aa		0.86	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	SPT8	P38915	602 aa		0.86	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	TEM1	P38987	245 aa		0.86	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	PRM9	P39551	298 aa		0.86	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	RTT105	P40063	208 aa		0.86	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	DDI1	P40087	428 aa		0.86	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	AGX1	P43567	385 aa		0.86	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	YJL118W	P47022	219 aa		0.86	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	YJR012C	P47087	207 aa		0.86	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	GPI8	P49018	411 aa		0.86	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	MDM34	P53083	459 aa		0.86	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	MAL13	P53338	473 aa		0.86	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	EMI1	Q04406	187 aa		0.86	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	BOP2	Q06150	570 aa		0.86	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	COX2	P00410	251 aa		0.85	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	OM45	P16547	393 aa		0.85	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	RIB7	P33312	244 aa		0.85	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	ECM13	P38195	257 aa		0.85	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	DSN1	P40568	576 aa		0.85	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	YJL016W	P47072	561 aa		0.85	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	CAB4	P53332	305 aa		0.85	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	0.85	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	AAH1	P53909	347 aa		0.85	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	SLD7	Q08457	257 aa		0.85	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	PST1	Q12355	444 aa		0.85	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	GEP5	Q12393	293 aa		0.85	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		0.85	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	RAD3	P06839	778 aa		0.84	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	POX1	P13711	748 aa		0.84	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	CWP1	P28319	239 aa		0.84	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	QRI5	P32344	111 aa		0.84	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	DRE2	P36152	348 aa		0.84	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	PET100	P38958	111 aa		0.84	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	COG3	P40094	801 aa		0.84	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	MEP1	P40260	492 aa		0.84	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	YPR011C	Q12251	326 aa		0.84	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		0.84	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
RRT1	YBL048W	DAL82	P21705	255 aa		0.83	□□□□□ -2.28
RRT1	YBL048W	SEC22	P22214	214 aa		0.83	□□□□□ -2.28
RRT1	YBL048W	VPS3	P23643	1011 aa		0.83	□□□□□ -2.28
RRT1	YBL048W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
RRT1	YBL048W	YHL026C	P38740	315 aa		0.83	□□□□□ -2.28
RRT1	YBL048W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
RRT1	YBL048W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	0.83	□□□□□ -2.28
RRT1	YBL048W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
RRT1	YBL048W	YAR1	P46683	200 aa		0.83	□□□□□ -2.28

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