RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, human

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PMS1-222	ENST00000639501	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		21.93	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	NARF	Q9UHQ1	456 aa		21.93	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	EML1	O00423	815 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	SLC26A4	O43511	780 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	21.92	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	21.92	■■□□□ 1.1	1e-16	■■■■■ 250
PMS1-222	ENST00000639501	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501		H0Y3Z8	333 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	MEIS2	O14770	477 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	IVD	P26440	423 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	GABPA	Q06546	454 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	MYCT1	Q8N699	235 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	21.92	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	TTC8	Q8TAM2	541 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	ERMN	Q8TAM6	284 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	STK32A	Q8WU08	396 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	KAT5	Q92993	513 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	21.92	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	CHST7	Q9NS84	486 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	SPOP	O43791	374 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	ATP5D	P30049	168 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	DLG4	P78352	724 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	21.91	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	21.91	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	21.91	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	WHRN	Q9P202	907 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	THAP12	O43422	761 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	ITGA8	P53708	1063 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	21.91	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	DNAJC3	Q13217	504 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	NSMF	Q6X4W1	530 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	FIZ1	Q96SL8	496 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	21.91	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	LRRC19	Q9H756	370 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	PIDD1	Q9HB75	910 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	EPHB2	P29323	1055 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	VPS41	P49754	854 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	SNAP25	P60880	206 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	PARP6	Q2NL67	630 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	21.9	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	VSIG1	Q86XK7	387 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	CNBD1	Q8NA66	436 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	21.9	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	SYT15	Q9BQS2	421 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	VAV3	Q9UKW4	847 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	PLSCR1	O15162	318 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	FAM13A	O94988	1023 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	FES	P07332	822 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	T-ENOL	P0DO92	83 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	21.9	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	21.89	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	21.89	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	RAD21	O60216	631 aa		21.89	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	SGPL1	O95470	568 aa		21.89	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	SGO2	Q562F6	1265 aa		21.89	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		21.89	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		21.89	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		21.89	■■□□□ 1.1
PMS1-222	ENST00000639501	KLHL33	A6NCF5	533 aa		21.89	■■□□□ 1.09
PMS1-222	ENST00000639501	CBX6	O95503	412 aa		21.89	■■□□□ 1.09
PMS1-222	ENST00000639501	EYA4	O95677	639 aa		21.89	■■□□□ 1.09
PMS1-222	ENST00000639501	ATP6V1C1	P21283	382 aa		21.89	■■□□□ 1.09
PMS1-222	ENST00000639501	PCK1	P35558	622 aa		21.89	■■□□□ 1.09
PMS1-222	ENST00000639501	STRN3	Q13033	797 aa		21.89	■■□□□ 1.09
PMS1-222	ENST00000639501	TCEAL1	Q15170	157 aa		21.89	■■□□□ 1.09
PMS1-222	ENST00000639501	TEX9	Q8N6V9	391 aa		21.89	■■□□□ 1.09
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	21.89	■■□□□ 1.09
PMS1-222	ENST00000639501	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	21.89	■■□□□ 1.09
PMS1-222	ENST00000639501	SETDB2	Q96T68	719 aa		21.89	■■□□□ 1.09
PMS1-222	ENST00000639501	NUP85	Q9BW27	656 aa		21.89	■■□□□ 1.09
PMS1-222	ENST00000639501	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		21.89	■■□□□ 1.09
PMS1-222	ENST00000639501	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		21.89	■■□□□ 1.09
PMS1-222	ENST00000639501	MSH4	O15457	936 aa		21.88	■■□□□ 1.09
PMS1-222	ENST00000639501	ENTPD5	O75356	428 aa		21.88	■■□□□ 1.09

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