RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616306.1

UBXN8-208, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN8, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-208ENST00000616306 OFD1O75665 1012 aa11.22□□□□□ -0.61
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UBXN8-208ENST00000616306 IL9P15248 144 aa11.19□□□□□ -0.62
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UBXN8-208ENST00000616306 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
UBXN8-208ENST00000616306 KCNC3Q14003 757 aa11.19□□□□□ -0.62
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