RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616074.4

TRAPPC3-208, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-208ENST00000616074 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3-208ENST00000616074 TADA2AO75478 443 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3-208ENST00000616074 EDN1P05305 212 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3-208ENST00000616074 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3-208ENST00000616074 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3-208ENST00000616074 TUSC3Q13454 348 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3-208ENST00000616074 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3-208ENST00000616074 GPR65Q8IYL9 337 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3-208ENST00000616074 HASPINQ8TF76 798 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3-208ENST00000616074 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3-208ENST00000616074 CXCL16Q9H2A7 254 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3-208ENST00000616074 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3-208ENST00000616074 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3-208ENST00000616074 SNTG2Q9NY99 539 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3-208ENST00000616074 USP20Q9Y2K6 914 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3-208ENST00000616074 VPS13AQ96RL7 3174 aa22.95■■□□□ 1.27
TRAPPC3-208ENST00000616074 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 CASTOR2A6NHX0 329 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 PTGESO14684 152 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.266e-6■■■■■ 103.4
TRAPPC3-208ENST00000616074 PAPLNO95428 1278 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 C1RP00736 705 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 PRKCBP05771 671 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 CYP11B2P19099 503 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 RTP2Q5QGT7 225 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 LILRA6Q6PI73 481 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 FLCNQ8NFG4 579 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 STAMQ92783 540 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 CFAP54Q96N23 3096 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 IGSF9Q9P2J2 1179 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 VWA8A3KMH1 1905 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 NARSO43776 548 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 GFRA3O60609 400 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 RECQL4O94761 1208 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 KIF4AO95239 1232 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 LIG1P18858 919 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 NAMPTP43490 491 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 CLCN5P51795 746 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 CREMQ03060 361 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 ECM1Q16610 540 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 MAPK6Q16659 721 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 TTC38Q5R3I4 469 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 RSAD2Q8WXG1 361 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 MYADMQ96S97 322 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 EPS15L1Q9UBC2 864 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 ACKR2O00590 384 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 NPR3P17342 541 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 NAB2Q15742 525 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 EEF1DP3Q658K8 133 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 DEPTORQ8TB45 409 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 PIDD1Q9HB75 910 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 POLD4Q9HCU8 107 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 FBXL21Q9UKT6 434 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 TRIP11Q15643 1979 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 ST18O60284 1047 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 THP07101 528 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 NBR1Q14596 966 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 SIX5Q8N196 739 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 ADPGKQ9BRR6 497 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 PRKD2Q9BZL6 878 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 DOCK6Q96HP0 2047 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 PI15O43692 258 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 AOC1P19801 751 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 MUTP22033 750 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 PPP2R5AQ15172 486 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 TTPALQ9BTX7 342 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 GDAQ9Y2T3 454 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZMYND10O75800 440 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 CFHP08603 1231 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 CEP57Q86XR8 500 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 CLSTN3Q9BQT9 956 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 FBXW11Q9UKB1 542 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-208ENST00000616074 PROB1E7EW31 1015 aa22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC3-208ENST00000616074 TRAPPC10P48553 1259 aa22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC3-208ENST00000616074 PSMD5Q16401 504 aa22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC3-208ENST00000616074 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms