RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614239.1

LHX1-201, Transcript of LIM homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LHX1, Length 3,425 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1-201ENST00000614239 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa15.01□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 LAMA4Q16363 1823 aa15.01□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 SMCO2A6NFE2 343 aa15.01□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 RIPK2O43353 540 aa15.01□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 EXOC3O60645 756 aa15.01□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 RPL21P46778 160 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 LSAMPQ13449 338 aa15.01□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa15.01□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 CCDC125Q86Z20 511 aa15.01□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 KBTBD2Q8IY47 623 aa15.01□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 ACTRT1Q8TDG2 376 aa15.01□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 PWWP2AQ96N64 755 aa15.01□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 SMYD3Q9H7B4 428 aa15.01□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 LTBP4Q8N2S1 1624 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 LAMB4A4D0S4 1761 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 KRT18P05783 430 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 CALM1P0DP23 149 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 CALM2P0DP24 149 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 CALM3P0DP25 149 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 HARSP12081 509 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 SLC16A2P36021 539 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 HPCAP84074 193 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 ZBTB46Q86UZ6 589 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 SH3TC2Q8TF17 1288 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 CKAP2Q8WWK9 683 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 C9orf72Q96LT7 481 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 ZNF148Q9UQR1 794 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 PFASO15067 1338 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 ZBED4O75132 1171 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 HAUS5O94927 633 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 RHOBTB3O94955 611 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 CCDC166P0CW27 439 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 MYH7P12883 1935 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 AMPD3Q01432 767 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 MPP2Q14168 576 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 PARP6Q2NL67 630 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 C1orf146Q5VVC0 180 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 HGSNATQ68CP4 663 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 RGS9BPQ6ZS82 235 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 NLRP9Q7RTR0 991 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 PRUNE1Q86TP1 453 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 SESTD1Q86VW0 696 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 ATP8B4Q8TF62 1192 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 TMOD2Q9NZR1 351 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 PAPPAQ13219 1627 aa15□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 SPTLC1O15269 473 aa14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 XPOTO43592 962 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 CCNB1P14635 433 aa14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 PTPN4P29074 926 aa14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 CDK7P50613 346 aa14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 GLIS3Q8NEA6 775 aa14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 GRIP2Q9C0E4 1043 aa14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 ARMCX1Q9P291 453 aa14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 PRKAG3Q9UGI9 489 aa14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 TNS2Q63HR2 1409 aa14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 SERPINB6P35237 376 aa14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 LONP1P36776 959 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 KDSRQ06136 332 aa14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 MTFR1Q15390 333 aa14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 MMEL1Q495T6 779 aa14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 TMEM53Q6P2H8 277 aa14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 CALML4Q96GE6 196 aa14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 PIGSQ96S52 555 aa14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 NDEL1Q9GZM8 345 aa14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 SYNCQ9H7C4 482 aa14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 TXNRD1Q16881 649 aa14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 WDR72Q3MJ13 1102 aa14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 TMCO4Q5TGY1 634 aa14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 CROCCP2Q86T23 111 aa14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 TRIM9Q9C026 710 aa14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa14.99□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 H3BRJ5 948 aa14.98□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 UFL1O94874 794 aa14.98□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 AMPD1P23109 780 aa14.98□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 FOXN2P32314 431 aa14.98□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 SCNN1DP51172 638 aa14.98□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 TSPY1Q01534 308 aa14.98□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 SEPT6Q14141 434 aa14.98□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 FIGNQ5HY92 759 aa14.98□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 TPCN2Q8NHX9 752 aa14.98□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 STK33Q9BYT3 514 aa14.98□□□□□ -0.01
LHX1-201ENST00000614239 USP40Q9NVE5 1235 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms