RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 CHSY1Q86X52 802 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 KCNN4O15554 427 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC39A14Q15043 492 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF568Q3ZCX4 644 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 AKT1P31749 480 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 GOLGA8TH3BQL2 631 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 DMPKQ09013 629 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 P3H2Q8IVL5 708 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 TFDP2Q14188 446 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 MICU2Q8IYU8 434 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 BEST2Q8NFU1 509 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 CYFIP2Q96F07 1278 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 ATP6V1C1P21283 382 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 ARSEP51690 589 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 IFNEQ86WN2 208 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 KLHL25Q9H0H3 589 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 CDYLQ9Y232 598 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 UBE2SQ16763 222 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 EFHC2Q5JST6 749 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 HS6ST3Q8IZP7 471 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 BMP3P12645 472 aa19.58■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 LCP1P13796 627 aa19.58■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 TRPC7Q9HCX4 862 aa19.58■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 CROCCQ5TZA2 2017 aa19.58■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 MYH7P12883 1935 aa19.58■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 GLMNQ92990 594 aa19.58■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 CAND2O75155 1236 aa19.58■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 USP17L2Q6R6M4 530 aa19.58■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 OMA1Q96E52 524 aa19.58■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 OSBPL9Q96SU4 736 aa19.58■□□□□ 0.73
PTPRJ-207ENST00000613246 SGO1Q5FBB7 561 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 TMC5Q6UXY8 1006 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 ANKMY2Q8IV38 441 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 PGBD3Q8N328 593 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 TRIM62Q9BVG3 475 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 WWP1Q9H0M0 922 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 FANCAO15360 1455 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 AIM2O14862 343 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 FYNP06241 537 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 VN1R5Q7Z5H4 357 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 GDF11O95390 407 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 SERPINB4P48594 390 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 PHKG1Q16816 387 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 SFR1Q86XK3 245 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 HDHD2Q9H0R4 259 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 SYCP2LQ5T4T6 812 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 ATP10DQ9P241 1426 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 FGFR4P22455 802 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 RAD51Q06609 339 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 ELMO2Q96JJ3 720 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 KIFC1Q9BW19 673 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 SPATA16Q9BXB7 569 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 WNT8AQ9H1J5 351 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 ZFATQ9P243 1243 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 ABCC4O15439 1325 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 COX10Q12887 443 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM35BQ8NCS4 154 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 SH3TC2Q8TF17 1288 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 CMTM5Q96DZ9 223 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 EPB42P16452 691 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 HIST1H2ADP20671 130 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 BNIPLQ7Z465 357 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 VSTM4Q8IW00 320 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 CNDP1Q96KN2 507 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 HIST1H2AJQ99878 128 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 H2AFJQ9BTM1 129 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 ALBP02768 609 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 APRTP07741 180 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 CDH24Q86UP0 819 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 CD274Q9NZQ7 290 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 DNAJC12Q9UKB3 198 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 PDZK1P1A8MUH7 402 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 M0QYV0 167 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 ARMCX4Q5H9R4 360 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC17Q96LX7 622 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 AGAP3Q96P47 875 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 MMP1P03956 469 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC134Q9H6E4 229 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 ABHD10Q9NUJ1 306 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRJ-207ENST00000613246 SERPINB13Q9UIV8 391 aa19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms