RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 USP17L12C9JPN9 530 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 USP17L21D6R901 530 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 MARK3P27448 753 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 LIFRP42702 1097 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 KLHL24Q6TFL4 600 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 FAM47EQ6ZV65 393 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 DDHD1Q8NEL9 900 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 EXD1Q8NHP7 514 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 DNAJC12Q9UKB3 198 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 LMTK3Q96Q04 1460 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM24O15164 1050 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 KCNA1Q09470 495 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 KCNK16Q96T55 309 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF577Q9BSK1 485 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 EMILIN3Q9NT22 766 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 KLHL2O95198 593 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CAPN1P07384 714 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 UNC13DQ70J99 1090 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 RFT1Q96AA3 541 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CEP44Q9C0F1 390 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 GALNT8Q9NY28 637 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 GTSE1Q9NYZ3 720 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 VTI1BQ9UEU0 232 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CLEC11AQ9Y240 323 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 DYTNA2CJ06 578 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 TEX46H3BTG2 121 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 PLA2G4BP0C869 781 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ZMYND11Q15326 602 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CDH24Q86UP0 819 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 RNF139Q8WU17 664 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 IFT43Q96FT9 208 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PQC6 194 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CFAP69A5D8W1 941 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ENO4A6NNW6 628 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 IFNAR1P17181 557 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 SERPINB3P29508 390 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 STAT5AP42229 794 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 STAT5BP51692 787 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 FBXO42Q6P3S6 717 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 LONP2Q86WA8 852 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 COQ7Q99807 217 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ANO3Q9BYT9 981 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ANAPC7Q9UJX3 599 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CROCCQ5TZA2 2017 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 KITP10721 976 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CYP27A1Q02318 531 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 GPS1Q13098 491 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 UGP2Q16851 508 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CCT8L1PA6NM43 557 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 M0R2C6 588 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 FNTAP49354 379 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 RCAN1P53805 252 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 STX5Q13190 355 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 NSMFQ6X4W1 530 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC36Q8IYA8 594 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 SEC16BQ96JE7 1060 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 COPRSQ9NQ92 184 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 RGS20O76081 388 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 NPEPPSP55786 919 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ITIH4Q14624 930 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM16LQ309B1 348 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 MLXIPQ9HAP2 919 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ERVV-2B6SEH9 535 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CHP2O43745 196 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 S100A1P23297 94 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ACADLP28330 430 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 KCNQ4P56696 695 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 NFIAQ12857 509 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 FBXW10Q5XX13 1052 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CPXCR1Q8N123 301 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 KRT78Q8N1N4 520 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 C19orf18Q8NEA5 215 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 KRT84Q9NSB2 600 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM161AQ9NX61 479 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 A8MXQ7 604 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 PEX1O43933 1283 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 SRGAP2O75044 1071 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 VHLP40337 213 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 RAD51Q06609 339 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms