RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611205.4

CDKN3-211, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CDKN3, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3-211ENST00000611205 RTP3Q9BQQ7 232 aa26.98■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 PAAF1Q9BRP4 392 aa26.98■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 TUFT1Q9NNX1 390 aa26.98■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 EPS15L1Q9UBC2 864 aa26.98■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP26.97■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 PRR23AA6NEV1 266 aa26.97■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 CASTOR2A6NHX0 329 aa26.97■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 MED24O75448 989 aa26.97■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 RFX1P22670 979 aa26.97■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 NEK4P51957 841 aa26.97■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 GUCY1B3Q02153 619 aa26.97■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 CREMQ03060 361 aa26.97■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 TUSC3Q13454 348 aa26.97■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 FRMD5Q7Z6J6 570 aa26.97■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa26.97■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 TRIP11Q15643 1979 aa26.97■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 NEFLP07196 543 aa26.96■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 LIG1P18858 919 aa26.96■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 RTP2Q5QGT7 225 aa26.96■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 CCDC105Q8IYK2 499 aa26.96■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 GPR65Q8IYL9 337 aa26.96■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 PRKD2Q9BZL6 878 aa26.96■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 FZD8Q9H461 694 aa26.96■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 SNTG2Q9NY99 539 aa26.96■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 WNT16Q9UBV4 365 aa26.96■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 CA14Q9ULX7 337 aa26.96■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 VWA8A3KMH1 1905 aa26.96■■□□□ 1.91
CDKN3-211ENST00000611205 TTLL13PA6NNM8 815 aa26.95■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 N4BP3O15049 544 aa26.95■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 C1RP00736 705 aa26.95■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP26.95■■□□□ 1.9
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CDKN3-211ENST00000611205 POTEGQ6S5H5 508 aa26.95■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 CEP57Q86XR8 500 aa26.95■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 SLC44A3Q8N4M1 653 aa26.95■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 NACC1Q96RE7 527 aa26.95■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 C2orf40Q9H1Z8 148 aa26.95■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 PDZD7Q9H5P4 517 aa26.95■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 ZMYND10O75800 440 aa26.94■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 FAM187BQ17R55 369 aa26.94■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 DTWD2Q8NBA8 298 aa26.94■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 ERMNQ8TAM6 284 aa26.94■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 BSNDQ8WZ55 320 aa26.94■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP26.94■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 USP20Q9Y2K6 914 aa26.94■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 MYH15Q9Y2K3 1946 aa26.94■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 KRBA1A5PL33 1030 aa26.93■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 PTGESO14684 152 aa26.93■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 KIF4AO95239 1232 aa26.93■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 PRKCBP05771 671 aa26.93■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 THP07101 528 aa26.93■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 SRFP11831 508 aa26.93■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 LAMP2P13473 410 aa26.93■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 ST3GAL1Q11201 340 aa26.93■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 ANGPT1Q15389 498 aa26.93■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 MAPK6Q16659 721 aa26.93■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 FAM171A1Q5VUB5 890 aa26.93■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 PADI6Q6TGC4 694 aa26.93■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 NOSTRINQ8IVI9 506 aa26.93■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 NXPE3Q969Y0 559 aa26.93■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 ADPGKQ9BRR6 497 aa26.93■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 TTPALQ9BTX7 342 aa26.93■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 ARHGEF35A5YM69 484 aa26.92■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 RECQL4O94761 1208 aa26.92■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 PAPLNO95428 1278 aa26.92■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 ZNF174Q15697 407 aa26.92■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 PSMD5Q16401 504 aa26.92■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 DEPTORQ8TB45 409 aa26.92■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 CXCL16Q9H2A7 254 aa26.92■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 FBXW11Q9UKB1 542 aa26.92■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 OR52Z1P0C646 297 aa26.91■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 LIN9Q5TKA1 542 aa26.91■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 GPR152Q8TDT2 470 aa26.91■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 CLSTN3Q9BQT9 956 aa26.91■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 GDAQ9Y2T3 454 aa26.91■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 MYO15AQ9UKN7 3530 aa26.91■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 CYP11B2P19099 503 aa26.9■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 FSHRP23945 695 aa26.9■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 RPA1P27694 616 aa26.9■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 NAMPTP43490 491 aa26.9■■□□□ 1.9
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CDKN3-211ENST00000611205 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 PIK3R5Q8WYR1 880 aa26.9■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 C8orf76Q96K31 380 aa26.9■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 TBC1D17Q9HA65 648 aa26.9■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 NUMBLQ9Y6R0 609 aa26.9■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 FAM186AA6NE01 2351 aa26.89■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 ACKR2O00590 384 aa26.89■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 EDN1P05305 212 aa26.89■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 PPP2R5AQ15172 486 aa26.89■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 PPM1LQ5SGD2 360 aa26.89■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 EEF1DP3Q658K8 133 aa26.89■■□□□ 1.9
CDKN3-211ENST00000611205 SNX27Q96L92 541 aa26.89■■□□□ 1.9
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