RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	USP41	Q3LFD5	358 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	NECAB1	Q8N987	351 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	HASPIN	Q8TF76	798 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	FNIP2	Q9P278	1114 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	DPP7	Q9UHL4	492 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	CEP250	Q9BV73	2442 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	ANHX	E9PGG2	379 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	PTGES	O14684	152 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	NR1I2	O75469	434 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	KIF4A	O95239	1232 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	EDN1	P05305	212 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	LAMP2	P13473	410 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	FOSB	P53539	338 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	PIDD1	Q9HB75	910 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	PARP2	Q9UGN5	583 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338		R4GN57	208 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	13.23	□□□□□ -0.29	2e-15	■■■■□ 20.9
TTLL3-233	ENST00000602338	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	BTBD18	B2RXH4	712 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	ADAM12	O43184	909 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	NEMF	O60524	1076 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	ZMYND10	O75800	440 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	C1R	P00736	705 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	TXK	P42681	527 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	NTHL1	P78549	312 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	NAB2	Q15742	525 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	SPECC1	Q5M775	1068 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR65	Q8IYL9	337 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	HACE1	Q8IYU2	909 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	BSND	Q8WZ55	320 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	FGF14	Q92915	247 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	MTMR9	Q96QG7	549 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	USP20	Q9Y2K6	914 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	STK25	O00506	426 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	JAK2	O60674	1132 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	RECQL4	O94761	1208 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	GLUL	P15104	373 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	TUSC3	Q13454	348 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	ME3	Q16798	604 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	GTF3C6	Q969F1	213 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	NXPE3	Q969Y0	559 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	FOXQ1	Q9C009	403 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	FZD8	Q9H461	694 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRN2	O75325	713 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	MED24	O75448	989 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	TADA2A	O75478	443 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	RFX1	P22670	979 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	FSHR	P23945	695 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	FOXK2	Q01167	660 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	CREM	Q03060	361 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	ST3GAL1	Q11201	340 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	PSMD5	Q16401	504 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM187B	Q17R55	369 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	PARM1	Q6UWI2	310 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	WASF1	Q92558	559 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		13.21	□□□□□ -0.29

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.9 ms