RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-208ENST00000590422 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-208ENST00000590422 RECQL4O94761 1208 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 KIF4AO95239 1232 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP13.39□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 CLCN5P51795 746 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 FAM187BQ17R55 369 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 USP41Q3LFD5 358 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 EEF1DP3Q658K8 133 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 LILRA6Q6PI73 481 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 SIX5Q8N196 739 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 MCPH1Q8NEM0 835 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 PRIMPOLQ96LW4 560 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 CCDC113Q9H0I3 377 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 NT5C3AQ9H0P0 336 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 TUFT1Q9NNX1 390 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 EPS15L1Q9UBC2 864 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 MYH15Q9Y2K3 1946 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 COL4A3Q01955 1670 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 KRBA1A5PL33 1030 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 PROB1E7EW31 1015 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 NR1I2O75469 434 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 CFHP08603 1231 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 OR52Z1P0C646 297 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 LIG1P18858 919 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 AOC1P19801 751 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 TUSC3Q13454 348 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 NBR1Q14596 966 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 ZNF174Q15697 407 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 NAB2Q15742 525 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 ECM1Q16610 540 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 C8orf34Q49A92 452 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 PADI6Q6TGC4 694 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 NOSTRINQ8IVI9 506 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 CCDC83Q8IWF9 413 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 POLD4Q9HCU8 107 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 SNTG2Q9NY99 539 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 FNIP2Q9P278 1114 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 IGSF9Q9P2J2 1179 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 FBXL21Q9UKT6 434 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 NOTCH4Q99466 2003 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 SPTBN4Q9H254 2564 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 DCHS1Q96JQ0 3298 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP13.38□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 ADAM12O43184 909 aa13.37□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 TADA2AO75478 443 aa13.37□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 PRKCBP05771 671 aa13.37□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 CYP11B2P19099 503 aa13.37□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 RPA1P27694 616 aa13.37□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 NBL1P41271 181 aa13.37□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa13.37□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 CYP26C1Q6V0L0 522 aa13.37□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 FRMD5Q7Z6J6 570 aa13.37□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa13.37□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 GPR65Q8IYL9 337 aa13.37□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 STAMQ92783 540 aa13.37□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 C8orf76Q96K31 380 aa13.37□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 NACC1Q96RE7 527 aa13.37□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 PRKD2Q9BZL6 878 aa13.37□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa13.37□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa13.37□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 DPP7Q9UHL4 492 aa13.37□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 FBXW11Q9UKB1 542 aa13.37□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 ARHGEF35A5YM69 484 aa13.36□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 PRR23AA6NEV1 266 aa13.36□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 N4BP3O15049 544 aa13.36□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 ZMYND10O75800 440 aa13.36□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 NAMPTP43490 491 aa13.36□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 NTHL1P78549 312 aa13.36□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 HTR4Q13639 388 aa13.36□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 MAPK6Q16659 721 aa13.36□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 TMEM132AQ24JP5 1023 aa13.36□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 GLRA4Q5JXX5 417 aa13.36□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 TTC38Q5R3I4 469 aa13.36□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 FAM171A1Q5VUB5 890 aa13.36□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 CCDC105Q8IYK2 499 aa13.36□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 SLC44A3Q8N4M1 653 aa13.36□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 HDAC7Q8WUI4 952 aa13.36□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 PIK3R5Q8WYR1 880 aa13.36□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 CLSTN3Q9BQT9 956 aa13.36□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 TTPALQ9BTX7 342 aa13.36□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 C2orf40Q9H1Z8 148 aa13.36□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 PIDD1Q9HB75 910 aa13.36□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 CA14Q9ULX7 337 aa13.36□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 GDAQ9Y2T3 454 aa13.36□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 ANHXE9PGG2 379 aa13.35□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 ACKR2O00590 384 aa13.35□□□□□ -0.27
CTIF-208ENST00000590422 C1RP00736 705 aa13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms