RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571947.5

TRAPPC1-204, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRAPPC1, Length 306 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-204ENST00000571947 PHKA2P46019 1235 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 MBTD1Q05BQ5 628 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 MCL1Q07820 350 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 PPFIA1Q13136 1202 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 GRM1Q13255 1194 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 SURF1Q15526 300 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 NAB2Q15742 525 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 GRIK4Q16099 956 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 CCL14Q16627 93 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 FAM187BQ17R55 369 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 ARHGAP44Q17R89 818 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 ZACNQ401N2 412 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 MTHFD1LQ6UB35 978 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 TLK2Q86UE8 772 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 VPS36Q86VN1 386 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 BRSK2Q8IWQ3 736 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 METTL13Q8N6R0 699 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 FBXL13Q8NEE6 735 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 SLC30A5Q8TAD4 765 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 ZNF516Q92618 1163 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 SEMA4DQ92854 862 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 ERO1AQ96HE7 468 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 FAM81BQ96LP2 452 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 NLRP4Q96MN2 994 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 NT5C1BQ96P26 610 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 FNBP1Q96RU3 617 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 CGRRF1Q99675 332 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 SYT11Q9BT88 431 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 RAB20Q9NX57 234 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 THSD7BQ9C0I4 1608 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 A0A087WZ62 844 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 ANO9A1A5B4 782 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 BTNL10A8MVZ5 291 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 HAS3O00219 553 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.355e-28■■■■■ 29.1
TRAPPC1-204ENST00000571947 ZEB2O60315 1214 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 TACC1O75410 805 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 F2P00734 622 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 HLA-DRAP01903 254 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 GJB1P08034 283 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 DLATP10515 647 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 TNNI1P19237 187 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 TNFAIP3P21580 790 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 PSEN2P49810 448 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 CPT1AP50416 773 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 AP3M2P53677 418 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 MFAP3P55082 362 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 FCGRTP55899 365 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 WNT7BP56706 349 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 PTPRJQ12913 1337 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 MARCH8Q5T0T0 291 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 ATF7IP2Q5U623 682 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 EEF1DP3Q658K8 133 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 ZBTB33Q86T24 672 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 ZNF410Q86VK4 478 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 FAM71AQ8IYT1 594 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 TRIM58Q8NG06 486 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 OLIG1Q8TAK6 271 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 HELQQ8TDG4 1101 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 TAS1R2Q8TE23 839 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 SHC3Q92529 594 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 KAT2BQ92831 832 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 ZBTB10Q96DT7 871 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 KREMEN1Q96MU8 473 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 MAP7D2Q96T17 732 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 ZIC5Q96T25 663 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 TCHPQ9BT92 498 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 AP5M1Q9H0R1 490 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 MINDY3Q9H8M7 445 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 PDE11AQ9HCR9 933 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 PTPRHQ9HD43 1115 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 CDC23Q9UJX2 597 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC1-204ENST00000571947 NAGPAQ9UK23 515 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms