RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	RECQL4	O94761	1208 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	ASGR2	P07307	311 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	SPATA31D3	P0C874	917 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	DSG1	Q02413	1049 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	TUSC3	Q13454	348 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	TH	P07101	528 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	CDC25A	P30304	524 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	UST	Q9Y2C2	406 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	27.92	■■■□□ 2.06	6e-6	■■■■■ 103.4
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966		K7ERI5	159 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	CEP57	Q86XR8	500 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	TMX3	Q96JJ7	454 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	BRD1	O95696	1058 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	EDN1	P05305	212 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	GJB2	P29033	226 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	PEX3	P56589	373 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	CREM	Q03060	361 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	ASIC4	Q96FT7	647 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	PIDD1	Q9HB75	910 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	CHST7	Q9NS84	486 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	PRPH	P41219	470 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
PPP4C-208	ENST00000564966	PTGES	O14684	152 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	HIP1R	O75146	1068 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	RFPL2	O75678	378 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	KIF4A	O95239	1232 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	PLXNA3	P51805	1871 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	NHLH1	Q02575	133 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	DRC1	Q96MC2	740 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	EFEMP2	O95967	443 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	NPTX2	P47972	431 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	IL17A	Q16552	155 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	IER5L	Q5T953	404 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	PLIN2	Q99541	437 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	TGM5	O43548	720 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	OSTN	P61366	133 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	RTP2	Q5QGT7	225 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	STAM	Q92783	540 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	TCHP	Q9BT92	498 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	FNIP2	Q9P278	1114 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	PRRX2	Q99811	253 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	MYO10	Q9HD67	2058 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	PSMD5	Q16401	504 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	PRSS33	Q8NF86	280 aa		27.84	■■■□□ 2.05

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