RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 CDT1Q9H211 546 aa33.75■■■□□ 2.99
CMTM4-204ENST00000563952 CXCL16Q9H2A7 254 aa33.75■■■□□ 2.99
CMTM4-204ENST00000563952 ZHX3Q9H4I2 956 aa33.75■■■□□ 2.99
CMTM4-204ENST00000563952 STK39Q9UEW8 545 aa33.75■■■□□ 2.99
CMTM4-204ENST00000563952 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP33.75■■■□□ 2.99
CMTM4-204ENST00000563952 F8W810 466 aa33.74■■■□□ 2.99
CMTM4-204ENST00000563952 MAPTP10636 758 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
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CMTM4-204ENST00000563952 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
CMTM4-204ENST00000563952 FAM178BQ8IXR5 827 aa33.74■■■□□ 2.99
CMTM4-204ENST00000563952 MYCT1Q8N699 235 aa33.74■■■□□ 2.99
CMTM4-204ENST00000563952 RABGGTAQ92696 567 aa33.74■■■□□ 2.99
CMTM4-204ENST00000563952 COLEC11Q9BWP8 271 aa33.74■■■□□ 2.99
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CMTM4-204ENST00000563952 STK17AQ9UEE5 414 aa33.73■■■□□ 2.99
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CMTM4-204ENST00000563952 HAUS6Q7Z4H7 955 aa33.71■■■□□ 2.99
CMTM4-204ENST00000563952 SMRP1Q8NCR6 262 aa33.71■■■□□ 2.99
CMTM4-204ENST00000563952 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP33.71■■■□□ 2.99
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CMTM4-204ENST00000563952 CASTOR2A6NHX0 329 aa33.7■■■□□ 2.99
CMTM4-204ENST00000563952 C2CD2LO14523 706 aa33.7■■■□□ 2.99
CMTM4-204ENST00000563952 SOD2P04179 222 aa33.7■■■□□ 2.99
CMTM4-204ENST00000563952 GRM5P41594 1212 aa33.7■■■□□ 2.99
CMTM4-204ENST00000563952 PKP1Q13835 747 aa33.7■■■□□ 2.99
CMTM4-204ENST00000563952 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.99
CMTM4-204ENST00000563952 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa33.7■■■□□ 2.99
CMTM4-204ENST00000563952 TAS1R1Q7RTX1 841 aa33.7■■■□□ 2.99
CMTM4-204ENST00000563952 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP33.7■■■□□ 2.99
CMTM4-204ENST00000563952 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa33.7■■■□□ 2.99
CMTM4-204ENST00000563952 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa33.7■■■□□ 2.99
CMTM4-204ENST00000563952 K7ENM7 598 aa33.69■■■□□ 2.98
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CMTM4-204ENST00000563952 MCF2P10911 925 aa33.69■■■□□ 2.98
CMTM4-204ENST00000563952 PROZP22891 400 aa33.69■■■□□ 2.98
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CMTM4-204ENST00000563952 GLRA4Q5JXX5 417 aa33.69■■■□□ 2.98
CMTM4-204ENST00000563952 ANKRD54Q6NXT1 300 aa33.69■■■□□ 2.98
CMTM4-204ENST00000563952 CASP10Q92851 521 aa33.69■■■□□ 2.98
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CMTM4-204ENST00000563952 PAAF1Q9BRP4 392 aa33.69■■■□□ 2.98
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CMTM4-204ENST00000563952 DYMQ7RTS9 669 aa33.68■■■□□ 2.98
CMTM4-204ENST00000563952 APOL5Q9BWW9 433 aa33.68■■■□□ 2.98
CMTM4-204ENST00000563952 CD320Q9NPF0 282 aa33.68■■■□□ 2.98
CMTM4-204ENST00000563952 ADAM28Q9UKQ2 775 aa33.68■■■□□ 2.98
CMTM4-204ENST00000563952 TRAK2O60296 914 aa33.67■■■□□ 2.98
CMTM4-204ENST00000563952 TOM1L1O75674 476 aa33.67■■■□□ 2.98
CMTM4-204ENST00000563952 YEATS4O95619 227 aa33.67■■■□□ 2.98
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CMTM4-204ENST00000563952 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP33.67■■■□□ 2.98
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CMTM4-204ENST00000563952 GJD3Q8N144 294 aa33.67■■■□□ 2.98
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CMTM4-204ENST00000563952 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
CMTM4-204ENST00000563952 TRIP11Q15643 1979 aa33.67■■■□□ 2.98
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CMTM4-204ENST00000563952 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP33.66■■■□□ 2.98
CMTM4-204ENST00000563952 NAB2Q15742 525 aa33.66■■■□□ 2.98
CMTM4-204ENST00000563952 KIAA1841Q6NSI8 718 aa33.66■■■□□ 2.98
CMTM4-204ENST00000563952 FUT10Q6P4F1 479 aa33.66■■■□□ 2.98
CMTM4-204ENST00000563952 PDILTQ8N807 584 aa33.66■■■□□ 2.98
CMTM4-204ENST00000563952 HASPINQ8TF76 798 aa33.66■■■□□ 2.98
CMTM4-204ENST00000563952 BRD1O95696 1058 aa33.65■■■□□ 2.98
CMTM4-204ENST00000563952 EFEMP2O95967 443 aa33.65■■■□□ 2.98
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