RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560163.1

RABGGTA-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-214ENST00000560163 LTB4R2Q9NPC1 389 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 ARID2Q68CP9 1835 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 NOTCH4Q99466 2003 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 CD72P21854 359 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 AKAP5P24588 427 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 HOXA9P31269 272 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 MAGEA9P43362 315 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
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RABGGTA-214ENST00000560163 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 UBXN2BQ14CS0 331 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 ITFG1Q8TB96 612 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 ATRIPQ8WXE1 791 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 PAAF1Q9BRP4 392 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 LXNQ9BS40 222 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 APOL6Q9BWW8 343 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 ZSCAN32Q9NX65 697 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 RGL1Q9NZL6 768 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 SNX14Q9Y5W7 946 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa21.99■■□□□ 1.11
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RABGGTA-214ENST00000560163 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 GRIK3Q13003 919 aa21.99■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 EPHA7Q15375 998 aa21.99■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 INF2Q27J81 1249 aa21.99■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 OTUD6AQ7L8S5 288 aa21.99■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 PIK3R5Q8WYR1 880 aa21.99■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 HAS1Q92839 578 aa21.99■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 MTRQ99707 1265 aa21.99■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 CACNG4Q9UBN1 327 aa21.99■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 SHISA7A6NL88 538 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 POU2F2P09086 479 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 ARHGAP8P85298 464 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 PFKPQ01813 784 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 XKR9Q5GH70 373 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 PPP4R3AQ6IN85 833 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 GALNT17Q6IS24 598 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 NFKBIZQ9BYH8 718 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.118e-6■■■■■ 107
RABGGTA-214ENST00000560163 A0A1B0GUA9 196 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 ADAM12O43184 909 aa21.97■■□□□ 1.11
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RABGGTA-214ENST00000560163 TTPALQ9BTX7 342 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 KLK14Q9P0G3 267 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 TBX3O15119 743 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 CCL16O15467 120 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 DEXIO95424 95 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 TARSP26639 723 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 ARL2P36404 184 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 LMNB2Q03252 620 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 LIN9Q5TKA1 542 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 SLC27A1Q6PCB7 646 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 KRT25Q7Z3Z0 450 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 SKAP1Q86WV1 359 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 NPAS3Q8IXF0 933 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 ASAP3Q8TDY4 903 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 DYDC2Q96IM9 177 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 AIFM3Q96NN9 605 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 PHF20Q9BVI0 1012 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 CHD8Q9HCK8 2581 aa21.95■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 TBC1D4O60343 1298 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-214ENST00000560163 SLITRK3O94933 977 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-214ENST00000560163 NPTXRO95502 500 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-214ENST00000560163 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-214ENST00000560163 TUSC3Q13454 348 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-214ENST00000560163 TFDP1Q14186 410 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-214ENST00000560163 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-214ENST00000560163 NAB2Q15742 525 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-214ENST00000560163 PSMD5Q16401 504 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-214ENST00000560163 UVSSAQ2YD98 709 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-214ENST00000560163 FAM171A1Q5VUB5 890 aa21.95■■□□□ 1.1
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