RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558960.1

ADAMTS17-205, Transcript of ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17, humanhuman

TSL 2

Gene ADAMTS17, Length 571 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAMTS17-205ENST00000558960 MCL1Q07820 350 aa22.99■■□□□ 1.27
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ADAMTS17-205ENST00000558960 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.99■■□□□ 1.27
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZFP42Q96MM3 310 aa22.99■■□□□ 1.27
ADAMTS17-205ENST00000558960 MIOSQ9NXC5 875 aa22.99■■□□□ 1.27
ADAMTS17-205ENST00000558960 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.99■■□□□ 1.27
ADAMTS17-205ENST00000558960 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.99■■□□□ 1.27
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ADAMTS17-205ENST00000558960 COLGALT2Q8IYK4 626 aa22.97■■□□□ 1.27
ADAMTS17-205ENST00000558960 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.97■■□□□ 1.27
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ADAMTS17-205ENST00000558960 SLC11A1P49279 550 aa22.96■■□□□ 1.27
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ADAMTS17-205ENST00000558960 DSC1Q08554 894 aa22.96■■□□□ 1.27
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ADAMTS17-205ENST00000558960 VPS52Q8N1B4 723 aa22.92■■□□□ 1.26
ADAMTS17-205ENST00000558960 SNX27Q96L92 541 aa22.92■■□□□ 1.26
ADAMTS17-205ENST00000558960 UROC1Q96N76 676 aa22.92■■□□□ 1.26
ADAMTS17-205ENST00000558960 TSPAN18Q96SJ8 248 aa22.92■■□□□ 1.26
ADAMTS17-205ENST00000558960 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ADAMTS17-205ENST00000558960 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa22.92■■□□□ 1.26
ADAMTS17-205ENST00000558960 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ADAMTS17-205ENST00000558960 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.91■■□□□ 1.26
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