RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558776.1

MED28P6-201, Transcript of mediator complex subunit 28 pseudogene 6, humanhuman

BASIC

Gene MED28P6, Length 231 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28P6-201ENST00000558776 PPP3CAQ08209 521 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 MBTPS1Q14703 1052 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 RAB39AQ14964 217 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 ANKRD45Q5TZF3 282 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 BICRALQ6AI39 1079 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 TXNRD3Q86VQ6 643 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 ESX1Q8N693 406 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 FANCBQ8NB91 859 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 OR2I1PQ8NGU4 316 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 DDX11Q96FC9 970 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 MFSD14AQ96MC6 490 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 SAMD11Q96NU1 681 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 HEPHQ9BQS7 1158 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 G6PC3Q9BUM1 346 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 CNPPD1Q9BV87 410 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 C7orf69Q9H7B7 122 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 CNTD2Q9H8S5 307 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 VPS45Q9NRW7 570 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 TM7SF3Q9NS93 570 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 SACM1LQ9NTJ5 587 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 IRAK4Q9NWZ3 460 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 STOML1Q9UBI4 398 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 PLAGL2Q9UPG8 496 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 RAXQ9Y2V3 346 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 U3KQE9 123 aa4□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 A6NCN8 305 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 NPC1O15118 1278 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 SGSM2O43147 1006 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 CUTAO60888 179 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 PHF2O75151 1096 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 USP2O75604 605 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 PROCP04070 461 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 F13BP05160 661 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 POLBP06746 335 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 FTH1P19P0C7X4 201 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 GLI4P10075 376 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 PRKCAP17252 672 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 SYN1P17600 705 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 RRM1P23921 792 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 APEX1P27695 318 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 MGAT5Q09328 741 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 NFATC3Q12968 1075 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 SPARCL1Q14515 664 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 SEPT2Q15019 361 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 CCDC96Q2M329 555 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 C3orf38Q5JPI3 329 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 FBXO47Q5MNV8 452 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 FAM129CQ86XR2 697 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 SHISA5Q8N114 240 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 ANKS4BQ8N8V4 417 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 ARRDC4Q8NCT1 418 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 OR10H5Q8NGA6 315 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 OR6B3Q8NGW1 331 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 NETO1Q8TDF5 533 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 NUP133Q8WUM0 1156 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 ASB11Q8WXH4 323 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 LINC01599Q8WXQ3 324 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 RUBCNQ92622 972 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 PEX11GQ96HA9 241 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 DBNDD2Q9BQY9 259 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 UBN1Q9NPG3 1134 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 INCENPQ9NQS7 918 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 KCMF1Q9P0J7 381 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 ACSL6Q9UKU0 697 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 PCDHA6Q9UN73 950 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 WASF3Q9UPY6 502 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 SIT1Q9Y3P8 196 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 TTLL3Q9Y4R7 772 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa3.99□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 RPTORQ8N122 1335 aa3.98□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa3.98□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 A6NLC8 198 aa3.98□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 TRIM38O00635 465 aa3.98□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 AREL1O15033 823 aa3.98□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 ORC4O43929 436 aa3.98□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 TBC1D4O60343 1298 aa3.98□□□□□ -1.77
MED28P6-201ENST00000558776 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms