RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556262.5

SDR39U1-218, Transcript of short chain dehydrogenase/reductase family 39U member 1, humanhuman

TSL 2

Gene SDR39U1, Length 1,960 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SDR39U1-218ENST00000556262 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SDR39U1-218ENST00000556262 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SDR39U1-218ENST00000556262 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SDR39U1-218ENST00000556262 PMM2O15305 246 aa20.2■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 FCGRTP55899 365 aa20.2■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 NOGQ13253 232 aa20.2■□□□□ 0.82
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SDR39U1-218ENST00000556262 USP37Q86T82 979 aa20.2■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
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SDR39U1-218ENST00000556262 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
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SDR39U1-218ENST00000556262 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa20.2■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 PTPRJQ12913 1337 aa20.2■□□□□ 0.82
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SDR39U1-218ENST00000556262 TMOD1P28289 359 aa20.19■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 TNFSF9P41273 254 aa20.19■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 STAT1P42224 750 aa20.19■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 VAV2P52735 878 aa20.19■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa20.19■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 UBXN4Q92575 508 aa20.19■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 KAT5Q92993 513 aa20.19■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 CAPNS2Q96L46 248 aa20.19■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 A0A087X0T9 212 aa20.19■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 ABLIM1O14639 778 aa20.19■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 FAM189A1O60320 539 aa20.19■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 EVI5O60447 810 aa20.19■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 TADA3O75528 432 aa20.19■□□□□ 0.82
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SDR39U1-218ENST00000556262 ALDH1A1P00352 501 aa20.19■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 FAM228BP0C875 321 aa20.19■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 SOX5P35711 763 aa20.19■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 FLT3LGP49771 235 aa20.19■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 DMTNQ08495 405 aa20.19■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 DEFB115Q30KQ5 88 aa20.19■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.19■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 FNBP1Q96RU3 617 aa20.19■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 COQ4Q9Y3A0 265 aa20.19■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 CEP350Q5VT06 3117 aa20.18■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 TNNI1P19237 187 aa20.18■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 GTF2H1P32780 548 aa20.18■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 PRKCIP41743 596 aa20.18■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 SLC35F6Q8N357 371 aa20.18■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 FBXL13Q8NEE6 735 aa20.18■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 TRIB2Q92519 343 aa20.18■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 AP5M1Q9H0R1 490 aa20.18■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 MRFAP1Q9Y605 127 aa20.18■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 MYL3P08590 195 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 MAGEA1P43355 309 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 PHKA2P46019 1235 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 CLDN10P78369 228 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 SLC18A3Q16572 532 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 TMEM132AQ24JP5 1023 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 ATF7IP2Q5U623 682 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 EEF1DP3Q658K8 133 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 ZNF662Q6ZS27 426 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 NFKBIZQ9BYH8 718 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 RAB20Q9NX57 234 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 PRDM4Q9UKN5 801 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 V9GYY5 206 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 KRT86O43790 486 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 FERP16591 822 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 CPT1AP50416 773 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 GPC3P51654 580 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 PRKCZQ05513 592 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 MCL1Q07820 350 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 KIF5AQ12840 1032 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 PPM1KQ8N3J5 372 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 NLRP7Q8WX94 980 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 MACROD2A1Z1Q3 448 aa20.16■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.16■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 PROZP22891 400 aa20.16■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 ENPEPQ07075 957 aa20.16■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 TMEM62Q0P6H9 643 aa20.16■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 TRIM32Q13049 653 aa20.16■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 HIC1Q14526 733 aa20.16■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 MFSD10Q14728 455 aa20.16■□□□□ 0.82
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