RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555658.5

FOXN3-210, Transcript of forkhead box N3, human

TSL 3

Gene FOXN3, Length 648 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FOXN3-210	ENST00000555658	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	CD276	Q5ZPR3	534 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	LBX2	Q6XYB7	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	PROSER1	Q86XN7	944 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	CNPY4	Q8N129	248 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	CNTROB	Q8N137	903 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	RILPL2	Q969X0	211 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	EVI5L	Q96CN4	794 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	SGSM3	Q96HU1	749 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	MTFR1L	Q9H019	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	CSRNP2	Q9H175	543 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	RREB1	Q92766	1687 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	ABCC12	Q96J65	1359 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	HIP1	O00291	1037 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	PRODH	O43272	600 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	MSC	O60682	206 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	CUTA	O60888	179 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	TAF5L	O75529	589 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	SRGN	P10124	158 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	PTMS	P20962	102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	CSF2RB	P32927	897 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	TGFB2	P61812	414 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	STYK1	Q6J9G0	422 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	KCTD1	Q719H9	257 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	MASTL	Q96GX5	879 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	ST7	Q9NRC1	585 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	LY75	O60449	1722 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
FOXN3-210	ENST00000555658	ZNF839	A8K0R7	811 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	FOXS1	O43638	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	REC8	O95072	547 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	SOD2	P04179	222 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	FGFR2	P21802	821 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	COMT	P21964	271 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	GPR85	P60893	370 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	NSMF	Q6X4W1	530 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	WDR48	Q8TAF3	677 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	KCND1	Q9NSA2	647 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	EP400	Q96L91	3159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	XDH	P47989	1333 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	SBF2	Q86WG5	1849 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	GOLIM4	O00461	696 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	MAFG	O15525	162 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	LTF	P02788	710 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	APP	P05067	770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	FGFR1	P11362	822 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	CHML	P26374	656 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	ADORA1	P30542	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	ABHD18	Q0P651	414 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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