RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	POLI	Q9UNA4	740 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	MAGEA9	P43362	315 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	PSMC5	P62195	406 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	ADCY1	Q08828	1119 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	GAS6	Q14393	721 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	NTRK3	Q16288	839 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	MTSS1L	Q765P7	747 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	RNF149	Q8NC42	400 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	NETO1	Q8TDF5	533 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	TBCK	Q8TEA7	893 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	TM4SF5	O14894	197 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	B4GALT5	O43286	388 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	FCAR	P24071	287 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	CYP3A7	P24462	503 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	PML	P29590	882 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	GNA11	P29992	359 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	PFKP	Q01813	784 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	FERMT3	Q86UX7	667 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	CNNM3	Q8NE01	707 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	NELL2	Q99435	816 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	CSRNP2	Q9H175	543 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	CHRD	Q9H2X0	955 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	SLC37A4	O43826	429 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	TADA2A	O75478	443 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	ECI2	O75521	394 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	KIF4A	O95239	1232 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	RET	P07949	1114 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	PTEN	P60484	403 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	SATB1	Q01826	763 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	WDR44	Q5JSH3	913 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	CEP57	Q86XR8	500 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	CEP170P1	Q96L14	293 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	VAV3	Q9UKW4	847 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557		M0R2N6	131 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	ZZEF1	O43149	2961 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	CEBPB	P17676	345 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	HOXA9	P31269	272 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	GRM2	Q14416	872 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	NAB2	Q15742	525 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	NPY5R	Q15761	445 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	PSMD5	Q16401	504 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	CSRP2	Q16527	193 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	RGL1	Q9NZL6	768 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	NCAN	O14594	1321 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-222	ENST00000533557	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	PTGES	O14684	152 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	NR1I2	O75469	434 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	NPTXR	O95502	500 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	KCNA4	P22459	653 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	OR1D2	P34982	312 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	FNTB	P49356	437 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	RCAN1	P53805	252 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	RAB33A	Q14088	237 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	EMC2	Q15006	297 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	LIN9	Q5TKA1	542 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	NOTUM	Q6P988	496 aa		13.52	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms