RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516876.1

RNU6-928P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 928, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-928P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-928P-201ENST00000516876 HELLSQ9NRZ9 838 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 SMC4Q9NTJ3 1288 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 IRAK4Q9NWZ3 460 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 UCKL1Q9NWZ5 548 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 GALNT8Q9NY28 637 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 BTBD7Q9P203 1132 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 ABCF2Q9UG63 623 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 VAV3Q9UKW4 847 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC39A10Q9ULF5 831 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 TELO2Q9Y4R8 837 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 HMX2A2RU54 273 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 FITM1A5D6W6 292 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 CLCA1A8K7I4 914 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 F5H0A9 414 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 NFIBO00712 420 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 AREL1O15033 823 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 CYP26A1O43174 497 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 TEX33O43247 280 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 SRGAP3O43295 1099 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 ORC4O43929 436 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 AKR1B10O60218 316 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 TBC1D4O60343 1298 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 INMTO95050 263 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 CYBBP04839 570 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 KITP10721 976 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 MYL4P12829 197 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 FGFR2P21802 821 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 TACR1P25103 407 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 SERPINF1P36955 418 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 PER3P56645 1201 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 VAMP2P63027 116 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 MVKQ03426 396 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 TLE2Q04725 743 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 PRKCQQ04759 706 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 GRIN1Q05586 938 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 TMEM62Q0P6H9 643 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 SPARCL1Q14515 664 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 DGKDQ16760 1214 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 CCDC96Q2M329 555 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 C19orf54Q5BKX5 351 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM180BQ6P0A1 224 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 CNKSR3Q6P9H4 555 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 USP17L6PQ6QN14 398 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 PAQR3Q6TCH7 311 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF783Q6ZMS7 281 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 RINLQ6ZS11 566 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 RNF44Q7L0R7 432 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 KRT77Q7Z794 578 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM181AQ8N9Y4 354 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 ATG16L2Q8NAA4 619 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 PLBD2Q8NHP8 589 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 HEPHQ9BQS7 1158 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 G6PC3Q9BUM1 346 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 OSBPL6Q9BZF3 934 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 TMEM8AQ9HCN3 771 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 UBN1Q9NPG3 1134 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 NECTIN3Q9NQS3 549 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 ITM2CQ9NQX7 267 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 STAP2Q9UGK3 403 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 CPA4Q9UI42 421 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 USP19O94966 1318 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 hCG_1984214I3L0E3 225 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 ACKR2O00590 384 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 NPC1O15118 1278 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 SGSM2O43147 1006 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 SOAT2O75908 522 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 PAPLNO95428 1278 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 GASTP01350 101 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 F13BP05160 661 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 MALP21145 153 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 KCNJ5P48544 419 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 ARFIP2P53365 341 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 ITGA8P53708 1063 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 PPP3CAQ08209 521 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 NFIAQ12857 509 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 IKZF1Q13422 519 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-928P-201ENST00000516876 TRPC3Q13507 836 aa3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms