RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509351.5

VNN3-211, Transcript of vanin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VNN3, Length 1,700 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3-211ENST00000509351 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 CEP68Q76N32 757 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 SPPL3Q8TCT6 385 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 RFFLQ8WZ73 363 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 DPF3Q92784 378 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 TCTN2Q96GX1 697 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 MAML3Q96JK9 1138 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 BRIP1Q9BX63 1249 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 CD248Q9HCU0 757 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 PREBQ9HCU5 417 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 BTG4Q9NY30 223 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 CEP72Q9P209 647 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 NUMBLQ9Y6R0 609 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 NCOA1Q15788 1441 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 MLH3Q9UHC1 1453 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 PREX2Q70Z35 1606 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 CDC14CA4D256 554 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 ADAM23O75077 832 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 ZNF205O95201 554 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 ARIH2O95376 493 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 WISP1O95388 367 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 MX2P20592 715 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 AFMP43652 599 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 NOGQ13253 232 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 SPIDRQ14159 915 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 PLS1Q14651 629 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 ANKRD45Q5TZF3 282 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 TANGO2Q6ICL3 276 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 TTC7BQ86TV6 843 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 C2CD5Q86YS7 1000 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 TSPYL6Q8N831 410 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 RADILQ96JH8 1075 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 KCNC2Q96PR1 638 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 MYL10Q9BUA6 226 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 KATNAL1Q9BW62 490 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 RNF208Q9H0X6 261 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 ADGRE2Q9UHX3 823 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 GGA1Q9UJY5 639 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 DSEQ9UL01 958 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.05□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 A0A0B4J269 797 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 APOL3O95236 402 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 TNFRSF6BO95407 300 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 TIAF1O95411 115 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 EOMESO95936 686 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 NPR1P16066 1061 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 FPR2P25090 351 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 SDHAP31040 664 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 LRP8Q14114 963 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 DLGAP5Q15398 846 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 ADRM1Q16186 407 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 SULT6B1Q6IMI4 303 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 TMC6Q7Z403 805 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 HERC6Q8IVU3 1022 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 NLGN4XQ8N0W4 816 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 TCP11L2Q8N4U5 519 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 FANCBQ8NB91 859 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 FAM71BQ8TC56 605 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 WHAMMQ8TF30 809 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 STYXQ8WUJ0 223 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 RUBCNQ92622 972 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 AGXT2Q9BYV1 514 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 GHITMQ9H3K2 345 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 STK32BQ9NY57 414 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 SNX5Q9Y5X3 404 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 CNTLNQ9NXG0 1405 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa6.04□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 FAM234BA2RU67 622 aa6.03□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 SMTNL1A8MU46 457 aa6.03□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 M0R082 166 aa6.03□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 MASP2O00187 686 aa6.03□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
VNN3-211ENST00000509351 FAM200BP0CF97 657 aa6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms