RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 H3BML4 177 aa5.45□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 ITGA10O75578 1167 aa5.45□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 UBXN7O94888 489 aa5.45□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 JUNP05412 331 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 HTR1BP28222 390 aa5.45□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 CASRP41180 1078 aa5.45□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 SLURP1P55000 103 aa5.45□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 GJA9P57773 515 aa5.45□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 TBR1Q16650 682 aa5.45□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 MST1LQ2TV78 715 aa5.45□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 TTLL10Q6ZVT0 673 aa5.45□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 DAAM2Q86T65 1068 aa5.45□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 SH2D3CQ8N5H7 860 aa5.45□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 REPS2Q8NFH8 660 aa5.45□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 MDM1Q8TC05 714 aa5.45□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 TTC17Q96AE7 1141 aa5.45□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 PDCD2LQ9BRP1 358 aa5.45□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 ARMT1Q9H993 441 aa5.45□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 GPRC5DQ9NZD1 345 aa5.45□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC88BA6NC98 1476 aa5.45□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa5.45□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 ARHGAP6O43182 974 aa5.44□□□□□ -1.54
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POLR1B-215ENST00000498054 VSIG10L2P0DP72 767 aa5.44□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 GYPEP15421 78 aa5.44□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 SMARCA1P28370 1054 aa5.44□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 SLC6A9P48067 706 aa5.44□□□□□ -1.54
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POLR1B-215ENST00000498054 ADCY7P51828 1080 aa5.44□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 MAP2K6P52564 334 aa5.44□□□□□ -1.54
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POLR1B-215ENST00000498054 DSC2Q02487 901 aa5.44□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF827Q17R98 1081 aa5.44□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 KIAA0753Q2KHM9 967 aa5.44□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 RNF151Q2KHN1 245 aa5.44□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 CEP170Q5SW79 1584 aa5.44□□□□□ -1.54
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POLR1B-215ENST00000498054 OVCH2Q7RTZ1 564 aa5.44□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 C3orf20Q8ND61 904 aa5.44□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 OR7D4Q8NG98 312 aa5.44□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 SARGQ9BW04 601 aa5.44□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 BCO1Q9HAY6 547 aa5.44□□□□□ -1.54
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POLR1B-215ENST00000498054 LANCL2Q9NS86 450 aa5.44□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM140Q9NV12 185 aa5.44□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 TRPS1Q9UHF7 1281 aa5.44□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa5.44□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 NR2E3Q9Y5X4 410 aa5.44□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 KDM6BO15054 1643 aa5.44□□□□□ -1.54
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POLR1B-215ENST00000498054 H3BUI4 141 aa5.43□□□□□ -1.54
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POLR1B-215ENST00000498054 NPEPPSP55786 919 aa5.43□□□□□ -1.54
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POLR1B-215ENST00000498054 CDC42EP1Q00587 391 aa5.43□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 BRD3Q15059 726 aa5.43□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 NT5DC1Q5TFE4 455 aa5.43□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 IL31Q6EBC2 164 aa5.43□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 BORAQ6PGQ7 559 aa5.43□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa5.43□□□□□ -1.54
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POLR1B-215ENST00000498054 KLHDC4Q8TBB5 520 aa5.43□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 ARL8AQ96BM9 186 aa5.43□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 MBD6Q96DN6 1003 aa5.43□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 CYFIP2Q96F07 1278 aa5.43□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa5.43□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 B3GNT5Q9BYG0 378 aa5.43□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 USP40Q9NVE5 1235 aa5.43□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 USP25Q9UHP3 1055 aa5.43□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 POLHQ9Y253 713 aa5.43□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 SIK3Q9Y2K2 1263 aa5.43□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa5.43□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 GRIN2BQ13224 1484 aa5.43□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 ADAMTS12P58397 1594 aa5.42□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 HECW2Q9P2P5 1572 aa5.42□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 A6NNZ2 444 aa5.42□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 APAF1O14727 1248 aa5.42□□□□□ -1.54
POLR1B-215ENST00000498054 TPP1O14773 563 aa5.42□□□□□ -1.54
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