RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492275.5

TTC3-223, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 3

Gene TTC3, Length 769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-223	ENST00000492275	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		28.26	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	28.26	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	28.26	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	BICD1	Q96G01	975 aa		28.26	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	GBP3	Q9H0R5	595 aa		28.26	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		28.26	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		28.25	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	28.25	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	LIG4	P49917	911 aa		28.25	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	KCNA1	Q09470	495 aa		28.25	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		28.25	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	UNC13D	Q70J99	1090 aa		28.25	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		28.25	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		28.25	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	HVCN1	Q96D96	273 aa		28.25	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		28.25	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		28.24	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	28.24	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	CLDN3	O15551	220 aa		28.24	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF202	O95125	648 aa		28.24	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	GCNT3	O95395	438 aa		28.24	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	28.24	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	SLC11A1	P49279	550 aa		28.24	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	28.24	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	OSTN	P61366	133 aa		28.24	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	PLCB3	Q01970	1234 aa		28.24	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	EHHADH	Q08426	723 aa		28.24	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	28.24	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		28.24	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		28.24	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		28.24	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	SPG21	Q9NZD8	308 aa		28.24	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	PTGES	O14684	152 aa		28.23	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	DSC1	Q08554	894 aa		28.23	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	28.23	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	PTPRO	Q16827	1216 aa		28.23	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	SEZ6	Q53EL9	994 aa		28.23	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	28.23	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		28.23	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	POF1B	Q8WVV4	589 aa		28.23	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	28.23	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	28.23	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		28.23	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		28.22	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		28.22	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	TISP43	B9A030	160 aa		28.22	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	28.22	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	KLRC4	O43908	158 aa		28.22	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		28.22	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		28.22	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	28.22	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	PPM1E	Q8WY54	764 aa		28.22	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		28.22	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		28.22	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	28.21	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	ALDH2	P05091	517 aa		28.21	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	PPM1A	P35813	382 aa		28.21	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	28.21	■■■□□ 2.11	7e-7	■■■□□ 17
TTC3-223	ENST00000492275	UBE3A	Q05086	875 aa		28.21	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	GRIK3	Q13003	919 aa		28.21	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	ALCAM	Q13740	583 aa		28.21	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	XKR4	Q5GH76	650 aa		28.21	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	28.21	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	28.21	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	ACAP3	Q96P50	834 aa		28.21	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	28.21	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	ACCS	Q96QU6	501 aa		28.21	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		28.21	■■■□□ 2.11
TTC3-223	ENST00000492275		A0A0B4J269	797 aa		28.2	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	NRP1	O14786	923 aa		28.2	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	FAM189A1	O60320	539 aa		28.2	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	28.2	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	NAB2	Q15742	525 aa		28.2	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		28.2	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		28.2	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	IGSF21	Q96ID5	467 aa		28.2	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	LZTS1	Q9Y250	596 aa		28.2	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		28.2	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	28.2	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	PRR29	P0C7W0	189 aa		28.19	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	IRS1	P35568	1242 aa		28.19	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		28.19	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	28.19	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		28.19	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	COL6A3	P12111	3177 aa		28.18	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	CSPG5	O95196	566 aa		28.18	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	MYL1	P05976	194 aa		28.18	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	TH	P07101	528 aa		28.18	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	ADSS	P30520	456 aa		28.18	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	HOXD13	P35453	343 aa		28.18	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	ERVFC1	P60507	584 aa		28.18	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	KRT17	Q04695	432 aa		28.18	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		28.18	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	SNX27	Q96L92	541 aa		28.18	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		28.18	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		28.17	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	CARNS1	A5YM72	827 aa		28.17	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	OGT	O15294	1046 aa		28.17	■■■□□ 2.1

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