RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	CALML3	P27482	149 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIR3DL1	P43629	444 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBXN2A	P68543	259 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	CNTN2	Q02246	1040 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC39A14	Q15043	492 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANO1	Q5XXA6	986 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	GALNT17	Q6IS24	598 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	USP49	Q70CQ1	688 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	BRAP	Q7Z569	592 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPT2	Q8TD30	523 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	TBCK	Q8TEA7	893 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRRC15	Q8TF66	581 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	CAPNS2	Q96L46	248 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	MBOAT7	Q96N66	472 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	UIMC1	Q96RL1	719 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANO3	Q9BYT9	981 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	C6orf50	Q9HD87	102 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNTG2	Q9NY99	539 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIF3A	Q9Y496	699 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266		U3KQE9	123 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	ABCB11	O95342	1321 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	PARP14	Q460N5	1801 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM86B1	E9PN63	330 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	FIBP	O43427	364 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CBFA2T2	O43439	604 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	COBL	O75128	1261 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CFB	P00751	764 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	POLR2M	P0CAP2	368 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ITGB5	P18084	799 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	PTGS1	P23219	599 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	SREBF1	P36956	1147 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	OAZ1	P54368	228 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	OXCT1	P55809	520 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRIM29	Q14134	588 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	TTC38	Q5R3I4	469 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	C17orf99	Q6UX52	265 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	FBXL6	Q8N531	539 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	HAS1	Q92839	578 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CUL5	Q93034	780 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLIC6	Q96NY7	704 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	MTMR9	Q96QG7	549 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ST7	Q9NRC1	585 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CPA4	Q9UI42	421 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A087X0B3	334 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRR19	A6NJB7	356 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDPK1	O15530	556 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	PGK2	P07205	417 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYP3A4	P08684	503 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYP3A7	P24462	503 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	GNA11	P29992	359 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CIITA	P33076	1130 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	MCM7	P33993	719 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	GRM1	Q13255	1194 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRHR2	Q13324	411 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLS1	Q14651	629 aa		6.95	□□□□□ -1.3

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