RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 PHTF1Q9UMS5 762 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 TSPOAP1O95153 1857 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 KLRF2D3W0D1 207 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 H3BSA7 217 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADCY6O43306 1168 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 VCPP55072 806 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 PDK3Q15120 406 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 DCAF6Q58WW2 860 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPOPLQ6IQ16 392 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLNKQ7Z7G1 428 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 CROCCP3Q8IVE0 287 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 SCYL3Q8IZE3 742 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 RNF169Q8NCN4 708 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR6Y1Q8NGX8 325 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 TTC1Q99614 292 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 MMRN2Q9H8L6 949 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 SIAEQ9HAT2 523 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC38A7Q9NVC3 462 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZFP69BQ9UJL9 534 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 NR2E3Q9Y5X4 410 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 TEX28O15482 410 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 DNAJC6O75061 913 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 BAG2O95816 211 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 FGAP02671 866 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 UQCRBP14927 111 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 BRAFP15056 766 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 VCLP18206 1134 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 GNA11P29992 359 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 CHN2P52757 468 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 RASSF3Q86WH2 238 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM20CQ8IXL6 584 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 NCOA7Q8NI08 942 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 OSBP2Q969R2 916 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 SHISA4Q96DD7 197 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ERP44Q9BS26 406 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 MRGBPQ9NV56 204 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 GRHL1Q9NZI5 618 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 SEL1LQ9UBV2 794 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 DMTF1Q9Y222 760 aa7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 A0A088AWK7 358 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCDC22O60826 627 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 HAUS5O94927 633 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLPTM1O96005 669 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 AQP4P55087 323 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 WDR4P57081 412 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 NOP14P78316 857 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 NR1D2Q14995 579 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM266Q2M3C6 531 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ANKRD40Q6AI12 368 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 PDXDC1Q6P996 788 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 NLRX1Q86UT6 975 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 TTC39CQ8N584 583 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRRC57Q8N9N7 239 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 PYROXD1Q8WU10 500 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 PLGRKTQ9HBL7 147 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ERVK-5Q9HDB9 667 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 VTA1Q9NP79 307 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP40Q9NVE5 1235 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 VPS51Q9UID3 782 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC12A7Q9Y666 1083 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 A0A087X0T9 212 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 NOTOA8MTQ0 251 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 GYG2O15488 501 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 AP1G1O43747 822 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 GAS8O95995 478 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM228BP0C875 321 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 IL23RQ5VWK5 629 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM117BQ6P1L5 589 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 RNF111Q6ZNA4 994 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARPINQ7Z6K5 226 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 RASGEF1CQ8N431 466 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms