RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 CTSAP10619 480 aa29.4■■■□□ 2.3
CCZ1B-211ENST00000486840 MCF2P10911 925 aa29.4■■■□□ 2.3
CCZ1B-211ENST00000486840 MPZL3Q6UWV2 235 aa29.4■■■□□ 2.3
CCZ1B-211ENST00000486840 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
CCZ1B-211ENST00000486840 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
CCZ1B-211ENST00000486840 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa29.4■■■□□ 2.3
CCZ1B-211ENST00000486840 MYO7AQ13402 2215 aa29.4■■■□□ 2.3
CCZ1B-211ENST00000486840 SPDYE4A6NLX3 237 aa29.39■■■□□ 2.3
CCZ1B-211ENST00000486840 HIDE1A8MVS5 230 aa29.39■■■□□ 2.3
CCZ1B-211ENST00000486840 TNFRSF10AO00220 468 aa29.39■■■□□ 2.3
CCZ1B-211ENST00000486840 CLDN3O15551 220 aa29.39■■■□□ 2.3
CCZ1B-211ENST00000486840 CUTAO60888 179 aa29.39■■■□□ 2.3
CCZ1B-211ENST00000486840 TOM1L1O75674 476 aa29.39■■■□□ 2.3
CCZ1B-211ENST00000486840 URODP06132 367 aa29.39■■■□□ 2.3
CCZ1B-211ENST00000486840 MAPTP10636 758 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
CCZ1B-211ENST00000486840 LIG4P49917 911 aa29.39■■■□□ 2.3
CCZ1B-211ENST00000486840 TUSC3Q13454 348 aa29.39■■■□□ 2.3
CCZ1B-211ENST00000486840 LLGL2Q6P1M3 1020 aa29.39■■■□□ 2.3
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
CCZ1B-211ENST00000486840 ACAP3Q96P50 834 aa29.39■■■□□ 2.3
CCZ1B-211ENST00000486840 ZBP1Q9H171 429 aa29.39■■■□□ 2.3
CCZ1B-211ENST00000486840 GRXCR2A6NFK2 248 aa29.38■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 C2orf71A6NGG8 1288 aa29.38■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 GRM5P41594 1212 aa29.38■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 ME1P48163 572 aa29.38■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 OSTNP61366 133 aa29.38■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 DSC1Q08554 894 aa29.38■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 ZPBP2Q6X784 338 aa29.38■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 DYMQ7RTS9 669 aa29.38■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 PPFIBP1Q86W92 1011 aa29.38■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 PDILTQ8N807 584 aa29.38■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 CASP10Q92851 521 aa29.38■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 CDT1Q9H211 546 aa29.38■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa29.38■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa29.38■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 EDN1P05305 212 aa29.37■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 LTBRP36941 435 aa29.37■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 NCKAP1LP55160 1127 aa29.37■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM13BQ9NYF5 915 aa29.37■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 TBX10O75333 385 aa29.36■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 SOD2P04179 222 aa29.36■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 AMPD3Q01432 767 aa29.36■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP29.36■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa29.36■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 C2CD2LO14523 706 aa29.35■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 B4GALT3O60512 393 aa29.35■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 IDEP14735 1019 aa29.35■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 GAP43P17677 238 aa29.35■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 KLRC2P26717 231 aa29.35■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF131P52739 623 aa29.35■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 KYAT1Q16773 422 aa29.35■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 TPRNQ4KMQ1 711 aa29.35■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 TAS1R3Q7RTX0 852 aa29.35■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 GSTCDQ8NEC7 633 aa29.35■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 AUTS2Q8WXX7 1259 aa29.35■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 DDX12PQ92771 950 aa29.35■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC38A7Q9NVC3 462 aa29.35■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 ADAM28Q9UKQ2 775 aa29.35■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 TBX20Q9UMR3 447 aa29.35■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 IRAK3Q9Y616 596 aa29.35■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 CASTOR2A6NHX0 329 aa29.34■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 GLUD2P49448 558 aa29.34■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 IQUBQ8NA54 791 aa29.34■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 CUEDC2Q9H467 287 aa29.34■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 PTPRHQ9HD43 1115 aa29.34■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 SEL1LQ9UBV2 794 aa29.34■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 IL9P15248 144 aa29.33■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 COASYQ13057 564 aa29.33■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 USP41Q3LFD5 358 aa29.33■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 UROC1Q96N76 676 aa29.33■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa29.33■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP29.33■■■□□ 2.29
CCZ1B-211ENST00000486840 CES5AQ6NT32 575 aa29.32■■■□□ 2.28
CCZ1B-211ENST00000486840 LRRC15Q8TF66 581 aa29.32■■■□□ 2.28
CCZ1B-211ENST00000486840 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
CCZ1B-211ENST00000486840 MARCH5Q9NX47 278 aa29.32■■■□□ 2.28
CCZ1B-211ENST00000486840 CLEC1BQ9P126 229 aa29.32■■■□□ 2.28
CCZ1B-211ENST00000486840 PRKAG3Q9UGI9 489 aa29.32■■■□□ 2.28
CCZ1B-211ENST00000486840 DPP7Q9UHL4 492 aa29.32■■■□□ 2.28
CCZ1B-211ENST00000486840 EXOC7Q9UPT5 735 aa29.32■■■□□ 2.28
CCZ1B-211ENST00000486840 PTGESO14684 152 aa29.31■■■□□ 2.28
CCZ1B-211ENST00000486840 MBTPS2O43462 519 aa29.31■■■□□ 2.28
CCZ1B-211ENST00000486840 PROZP22891 400 aa29.31■■■□□ 2.28
CCZ1B-211ENST00000486840 CREMQ03060 361 aa29.31■■■□□ 2.28
CCZ1B-211ENST00000486840 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
CCZ1B-211ENST00000486840 PKP1Q13835 747 aa29.31■■■□□ 2.28
CCZ1B-211ENST00000486840 PTPN14Q15678 1187 aa29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms