RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 MCUR1Q96AQ8 359 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 VCX3BQ9H321 246 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 NFU1Q9UMS0 254 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 C17orf102A2RUQ5 167 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 SDC4P31431 198 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 SOX5P35711 763 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 ZNF131P52739 623 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 INHBEP58166 350 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 CAPN12Q6ZSI9 719 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 PTF1AQ7RTS3 328 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 LTN1O94822 1766 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 MSH4O15457 936 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 NCK2O43639 380 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 IL18RAPO95256 599 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 MYBL1P10243 752 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 PAMP19021 973 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 SHMT1P34896 483 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 MOXD1Q6UVY6 613 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 GMCL1Q96IK5 515 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 FBXO28Q9NVF7 368 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 KRT33BQ14525 404 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 DRP2Q13474 957 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 CUL1Q13616 776 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 ALS2CLQ60I27 953 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 TRIM42Q8IWZ5 723 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 CCDC13Q8IYE1 715 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 HVCN1Q96D96 273 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 EPC1Q9H2F5 836 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 KCNH7Q9NS40 1196 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 ANAPC7Q9UJX3 599 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 TAP1Q03518 808 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 NCAPHQ15003 741 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 ZNF394Q53GI3 561 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 BTBD8Q5XKL5 378 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 TMEM270Q6UE05 265 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 RRAGCQ9HB90 399 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 FTLP02792 175 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 UCHL3P15374 230 aa14.47□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 SLC18A3Q16572 532 aa14.47□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 FBXL13Q8NEE6 735 aa14.47□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 ANKEF1Q9NU02 776 aa14.47□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 ZWINTO95229 277 aa14.47□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 CYP2C19P33261 490 aa14.47□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa14.47□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 ERGIC2Q96RQ1 377 aa14.47□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 NUDCD1Q96RS6 583 aa14.47□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 FMO2Q99518 471 aa14.47□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 MAGEB5Q9BZ81 275 aa14.47□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 SMIM22K7EJ46 135 aa14.47□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 DYRK4Q9NR20 520 aa14.47□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 TADA3O75528 432 aa14.47□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 CEP120Q8N960 986 aa14.47□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 SOCS4Q8WXH5 440 aa14.47□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 A0A1W2PQJ5 194 aa14.46□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 M0QYV0 167 aa14.46□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 NEMP1O14524 444 aa14.46□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 PLS3P13797 630 aa14.46□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 CYP11B2P19099 503 aa14.46□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 EMC2Q15006 297 aa14.46□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 HSPBP1Q9NZL4 362 aa14.46□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa14.46□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 TJP3O95049 919 aa14.46□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 ZNF484Q5JVG2 852 aa14.46□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 FKBP1CQ5VVH2 108 aa14.46□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 NYAP1Q6ZVC0 841 aa14.46□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 TMX2Q9Y320 296 aa14.46□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 CACNA1FO60840 1977 aa14.46□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 CHUKO15111 745 aa14.46□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 CTSHP09668 335 aa14.46□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 SREBF1P36956 1147 aa14.46□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 FMO5P49326 533 aa14.46□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 EFHC2Q5JST6 749 aa14.46□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 ANKRD7Q92527 254 aa14.46□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
NISCH-207ENST00000479054 RPS6P62753 249 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
NISCH-207ENST00000479054 APPL2Q8NEU8 664 aa14.46□□□□□ -0.1
NISCH-207ENST00000479054 VPS39Q96JC1 886 aa14.46□□□□□ -0.1
NISCH-207ENST00000479054 IRAK4Q9NWZ3 460 aa14.46□□□□□ -0.1
NISCH-207ENST00000479054 TLK1Q9UKI8 766 aa14.46□□□□□ -0.1
NISCH-207ENST00000479054 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP14.45□□□□□ -0.1
NISCH-207ENST00000479054 PFDN1O60925 122 aa14.45□□□□□ -0.1
NISCH-207ENST00000479054 PMLP29590 882 aa14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms