RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477486.1

RBMS1-211, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene RBMS1, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-211ENST00000477486 TUSC3Q13454 348 aa24.25■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa24.25■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 CCDC149Q6ZUS6 474 aa24.25■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 FBXL6Q8N531 539 aa24.25■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 TMX3Q96JJ7 454 aa24.25■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 CCDC113Q9H0I3 377 aa24.25■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 CACNG4Q9UBN1 327 aa24.25■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 USTQ9Y2C2 406 aa24.25■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 MYO10Q9HD67 2058 aa24.24■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa24.24■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 PP2D1A8MPX8 630 aa24.24■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 RECQL4O94761 1208 aa24.24■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 RILPL1Q5EBL4 403 aa24.24■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 ATF7IP2Q5U623 682 aa24.24■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 OTOP3Q7RTS5 596 aa24.24■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 CEP57Q86XR8 500 aa24.24■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa24.24■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 HASPINQ8TF76 798 aa24.24■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 RXFP1Q9HBX9 757 aa24.24■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP24.24■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 CHST7Q9NS84 486 aa24.24■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa24.24■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 ASGR2P07307 311 aa24.23■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 GJB2P29033 226 aa24.23■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 PRPHP41219 470 aa24.23■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 PEX3P56589 373 aa24.23■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa24.23■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 EEF1DP3Q658K8 133 aa24.23■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 UBALD2Q8IYN6 164 aa24.23■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 FEZF2Q8TBJ5 459 aa24.23■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 PAAF1Q9BRP4 392 aa24.23■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 PIDD1Q9HB75 910 aa24.23■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 MUC6Q6W4X9 2439 aa24.22■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP24.22■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 CREMQ03060 361 aa24.22■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 IL17AQ16552 155 aa24.22■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa24.22■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 ASIC4Q96FT7 647 aa24.22■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 HIP1RO75146 1068 aa24.21■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 EFEMP2O95967 443 aa24.21■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 RPL17P18621 184 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 NT5DC1Q5TFE4 455 aa24.21■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 FAM171A1Q5VUB5 890 aa24.21■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 DRC1Q96MC2 740 aa24.21■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 SMC3Q9UQE7 1217 aa24.21■■□□□ 1.47
RBMS1-211ENST00000477486 PTGESO14684 152 aa24.2■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 BRD1O95696 1058 aa24.2■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 EDN1P05305 212 aa24.2■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 NPTX2P47972 431 aa24.2■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 MCM2P49736 904 aa24.2■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa24.2■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 PLIN2Q99541 437 aa24.2■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 TCHPQ9BT92 498 aa24.2■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa24.2■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 KMT5AQ9NQR1 393 aa24.2■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 FNIP2Q9P278 1114 aa24.2■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 VWA3AA6NCI4 1184 aa24.19■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 TGM5O43548 720 aa24.19■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 RFPL2O75678 378 aa24.19■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 KIF4AO95239 1232 aa24.19■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 YARSP54577 528 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 NHLH1Q02575 133 aa24.19■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 IER5LQ5T953 404 aa24.19■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 RINT1Q6NUQ1 792 aa24.19■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 GPR65Q8IYL9 337 aa24.19■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 HDAC7Q8WUI4 952 aa24.19■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 STAMQ92783 540 aa24.19■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 PRRX2Q99811 253 aa24.19■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 TTPALQ9BTX7 342 aa24.19■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 RUSC1Q9BVN2 902 aa24.19■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 CXCL16Q9H2A7 254 aa24.19■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 TNFSF13BQ9Y275 285 aa24.19■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 SFI1A8K8P3 1242 aa24.18■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 OSTNP61366 133 aa24.18■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa24.18■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 GLRA4Q5JXX5 417 aa24.18■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 CYP26C1Q6V0L0 522 aa24.18■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 SMOC2Q9H3U7 446 aa24.18■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 TMEM134Q9H6X4 195 aa24.18■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
RBMS1-211ENST00000477486 PLXNA3P51805 1871 aa24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms