RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477112.1

DDX17-208, Transcript of DEAD-box helicase 17, human

TSL 2

Gene DDX17, Length 654 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX17-208	ENST00000477112	ZFYVE9	O95405	1425 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		3.36	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	UTRN	P46939	3433 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112		H7C1D1	291 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	TBX1	O43435	398 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	CFB	P00751	764 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	ADH4	P08319	380 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	CCDC159	P0C7I6	412 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	PLS3	P13797	630 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	KCNA6	P17658	529 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	LSS	P48449	732 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	SESN3	P58005	492 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	IDI1	Q13907	227 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	STAT4	Q14765	748 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	SLC9A5	Q14940	896 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	CHRNA2	Q15822	529 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	DDB1	Q16531	1140 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	KSR2	Q6VAB6	950 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	SKA1	Q96BD8	255 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	PGBD4	Q96DM1	585 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	MPP4	Q96JB8	637 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	CEP83	Q9Y592	693 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	KIF15	Q9NS87	1388 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		3.35	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	UNC13B	O14795	1591 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112		E9PCH4	1651 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	SHTN1	A0MZ66	631 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	BLACE	A4D250	179 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	KLHL33	A6NCF5	533 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112		A6NCN8	305 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112		H7BY64	318 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112		M0R2C6	588 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	ARVCF	O00192	962 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	CBX4	O00257	560 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	KRIT1	O00522	736 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	PIP5K1C	O60331	668 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	DGKI	O75912	1065 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	FKBP9	O95302	570 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	F2	P00734	622 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	SOD2	P04179	222 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	GYS1	P13807	737 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	GLUL	P15104	373 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	DNM2	P50570	870 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	NEK2	P51955	445 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	TMPRSS15	P98073	1019 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	PPP2R5B	Q15173	497 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	3.34	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
DDX17-208	ENST00000477112	NTRK3	Q16288	839 aa		3.34	□□□□□ -1.87

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