RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 TAS1R3Q7RTX0 852 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 GPR65Q8IYL9 337 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 VPS52Q8N1B4 723 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 TMEM87AQ8NBN3 555 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 GSTCDQ8NEC7 633 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 DDX12PQ92771 950 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 ZFP42Q96MM3 310 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 TSPAN18Q96SJ8 248 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 ZHX3Q9H4I2 956 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 SLC38A7Q9NVC3 462 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 CLDND1Q9NY35 253 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 DNAJB4Q9UDY4 337 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 TBX20Q9UMR3 447 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 CITO14578 2027 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 K7ENM7 598 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 PIGRP01833 764 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 CTSAP10619 480 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 PBX3P40426 434 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 OR1G1P47890 313 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 SLC11A1P49279 550 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 ERVFC1P60507 584 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 NUCB2P80303 420 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 PKP1Q13835 747 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 EEF1DP3Q658K8 133 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 SLFN12LQ6IEE8 588 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 BICD1Q96G01 975 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 UROC1Q96N76 676 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 ACAP3Q96P50 834 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 CDT1Q9H211 546 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 OLFML3Q9NRN5 406 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 SNTG2Q9NY99 539 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 EXOC7Q9UPT5 735 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 EDN1P05305 212 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 KCNA5P22460 613 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 IRS1P35568 1242 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 NRIP1P48552 1158 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 LIG4P49917 911 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 CREMQ03060 361 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 MCL1Q07820 350 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 DUSP6Q16828 381 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 DYMQ7RTS9 669 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 PPFIBP1Q86W92 1011 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 CCDC65Q8IXS2 484 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 PDILTQ8N807 584 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 LRRC15Q8TF66 581 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 SPATA32Q96LK8 384 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 ZBP1Q9H171 429 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 EPHX3Q9H6B9 360 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 KBTBD4Q9NVX7 518 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 USP25Q9UHP3 1055 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 PCDHA7Q9UN72 937 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 GDAQ9Y2T3 454 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 C2orf71A6NGG8 1288 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 MYMKA6NI61 221 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 CXCL14O95715 111 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 C1RP00736 705 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 SOD2P04179 222 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 CLTAP09496 248 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 NDUFV1P49821 464 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 POSTNQ15063 836 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 E2F4Q16254 413 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 XKR4Q5GH76 650 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 PLPP4Q5VZY2 271 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 RESP18Q5W5W9 173 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 ADALQ6DHV7 355 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 CNNM4Q6P4Q7 775 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 PDXDC1Q6P996 788 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 SHC4Q6S5L8 630 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 EP400NLQ6ZTU2 488 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 MAP4K3Q8IVH8 894 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 CD302Q8IX05 232 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 DNAJC19Q96DA6 116 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 PANK2Q9BZ23 570 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 IGFLR1Q9H665 355 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-211ENST00000476336 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms