RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473778.5

C9orf3-214, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 2,396 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-214ENST00000473778 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 CYP1B1Q16678 543 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 CCDC38Q502W7 563 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 DENND2CQ68D51 928 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 RPAINQ86UA6 219 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 UBL4BQ8N7F7 174 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 TAS1R2Q8TE23 839 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 FAM151AQ8WW52 585 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 PGM2Q96G03 612 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 CABS1Q96KC9 395 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 RPS6KC1Q96S38 1066 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 AAASQ9NRG9 546 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 DOCK5Q9H7D0 1870 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 P4HA2O15460 535 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 CYP1A2P05177 515 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 CREB1P16220 341 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 COILP38432 576 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 QARSP47897 775 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 NBPF9Q3BBW0 867 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF568Q3ZCX4 644 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 C2CD6Q53TS8 623 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 STYK1Q6J9G0 422 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 CPXCR1Q8N123 301 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 C3orf20Q8ND61 904 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 PARD3BQ8TEW8 1205 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 BSNDQ8WZ55 320 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 ART4Q93070 314 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 FAM212AQ96EL1 285 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 VEZTQ9HBM0 779 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 CLDN3O15551 220 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 C21orf2O43822 256 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 PLA2G6O60733 806 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 ATP2C2O75185 946 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 ICAM1P05362 532 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 DLATP10515 647 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 MAPTP10636 758 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 GZMAP12544 262 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 NCKAP1LP55160 1127 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 MTMR1Q13613 665 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 PPP2R5EQ16537 467 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 POTEAQ6S8J7 498 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 C1orf54Q8WWF1 131 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 CCT6BQ92526 530 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF653Q96CK0 615 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 CHMP6Q96FZ7 201 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 GMLQ99445 158 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 SELENOSQ9BQE4 189 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 PI4K2AQ9BTU6 479 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 CD248Q9HCU0 757 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 SLC40A1Q9NP59 571 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 PGAP2Q9UHJ9 254 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 CCDC189A1A4V9 331 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 O00370 1275 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 SMTNP53814 917 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 HOOK3Q86VS8 718 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 FMNL3Q8IVF7 1028 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 CCDC105Q8IYK2 499 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 ATG4AQ8WYN0 398 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 TAAR1Q96RJ0 339 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 WNT8AQ9H1J5 351 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 EHMT1Q9H9B1 1298 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 FEM1BQ9UK73 627 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 USP20Q9Y2K6 914 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 SPOPO43791 374 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 CNGA1P29973 690 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 SCTRP47872 440 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 NPTX2P47972 431 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 CETN1Q12798 172 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 TRAF1Q13077 416 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 AUHQ13825 339 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 FAM102BQ5T8I3 360 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 SEL1L2Q5TEA6 688 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 CCDC121Q6ZUS5 278 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 ANO5Q75V66 913 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 CPLX4Q7Z7G2 160 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 FAM160B2Q86V87 743 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 CENPTQ96BT3 561 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 PWWP2AQ96N64 755 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 CHST7Q9NS84 486 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 HAUS2Q9NVX0 235 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 RASAL2Q9UJF2 1139 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf3-214ENST00000473778 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.8 ms